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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001488`

染色体: Chr06 坐标: 15878155-15883012 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001488`
名称	SmilChr06G001488
描述	alpha carbonic anhydrase 4-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15878155 - 15883012 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990173`
GeneID	`130990173`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990173`
原始查询	`SmilChr06G001488`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha carbonic anhydrase 4-like
产物	alpha carbonic anhydrase 4-like
Arabidopsis	`AT5G56330` (ACA8) alpha carbonic anhydrase 8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835733] identity=47.1; qcov=0.944; evalue=6.54e-62; confidence=high
Rice	`Os08g0470200` (OsalphaCA6) - identity=40.9; qcov=1.12; evalue=2.74e-60; confidence=medium
GO	GO:0004089 (carbonate dehydratase activity); GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	smil00910 (Nitrogen metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00194 (Carb_anhydrase)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990173

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Secreted	分泌到胞外	1.00000	`XP_057770374.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770373.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770374.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770374.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770374.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15878460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B108,B22,B36,B81,C79
`Chr6:15879205`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B15
`Chr6:15881455`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B120
`Chr6:15881455`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B120
`Chr6:15881598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63
`Chr6:15882883`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B45,B63,B83,C17
`Chr6:15882892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C26,C37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770373.1

271 aa

136

271

Carb_anhydrase

PF00194 Carb_anhydrase 44-265 aa

XP_057770374.1

231 aa

116

231

Carb_anhydrase

PF00194 Carb_anhydrase 44-219 aa

XP_057770375.1

216 aa

108

216

Carb_anhydrase

PF00194 Carb_anhydrase 44-155 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770373.1`	Pfam	`PF00194`	Carb_anhydrase	Domain	44	265	7.4e-42	144.4	Eukaryotic-type carbonic anhydrase
`XP_057770374.1`	Pfam	`PF00194`	Carb_anhydrase	Domain	44	219	4.2e-29	102.6	Eukaryotic-type carbonic anhydrase
`XP_057770375.1`	Pfam	`PF00194`	Carb_anhydrase	Domain	44	155	1.8e-22	80.9	Eukaryotic-type carbonic anhydrase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914392.1
ACAAAATTAGGCGGAGGAACTGAAGAACTACCACCGCGACTCAGCCGCGCCACCACCTTCCCTACACCGATTCACGACGGATCTTATCACCAGAAACCACTATGGGCAGTCGTACGTACAGCTCCGCTCGTCGTTTCACTGCGTGTCTAATTTGTTTTTCCCTTCTCATGGCCATCAAAGCTGATGAAGTCGAGAACGAACATGAATTTACGTATCTGAGTAATTCTTCCAAGGGGCCACAACACTGGGGAAGTCTGAAA...

XM_057914391.1
ACAAAATTAGGCGGAGGAACTGAAGAACTACCACCGCGACTCAGCCGCGCCACCACCTTCCCTACACCGATTCACGACGGATCTTATCACCAGAAACCACTATGGGCAGTCGTACGTACAGCTCCGCTCGTCGTTTCACTGCGTGTCTAATTTGTTTTTCCCTTCTCATGGCCATCAAAGCTGATGAAGTCGAGAACGAACATGAATTTACGTATCTGAGTAATTCTTCCAAGGGGCCACAACACTGGGGAAGTCTGAAA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130990173
ATGGGCAGTCGTACGTACAGCTCCGCTCGTCGTTTCACTGCGTGTCTAATTTGTTTTTCCCTTCTCATGGCCATCAAAGCTGATGAAGTCGAGAACGAACATGAATTTACGTATCTGAGTAATTCTTCCAAGGGGCCACAACACTGGGGAAGTCTGAAAGAAGAATGGAAATTATGTTCAATTGGAAAGCTCCAATCCCCAATCGATGTTATGAATGAAAGAGTTTTGGTGTCGTCTGAAATTGGGAGATTGGTAAGAAA...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057770373.1
MGSRTYSSARRFTACLICFSLLMAIKADEVENEHEFTYLSNSSKGPQHWGSLKEEWKLCSIGKLQSPIDVMNERVLVSSEIGRLVRNYRAAPAVIKNRGHDIMIEWKEYAGGAYLTRNMYNLLQCHWHTPSEHTIGGRRYDLELHMVHRSSEGQTAVIAVLYNIGRSDPFLDKVLANLNDPTKSKEEIDLGVVDPWEIKFGSRKYFRYLGSLTVPPCTEGVVWTLLKKVRTASRKQIAALREAVHDGFEDNARPLQPLHD...

XP_057770374.1
MGSRTYSSARRFTACLICFSLLMAIKADEVENEHEFTYLSNSSKGPQHWGSLKEEWKLCSIGKLQSPIDVMNERVLVSSEIGRLVRNYRAAPAVIKNRGHDIMIEWKEYAGGAYLTRNMYNLLQCHWHTPSEHTIGGRRYDLELHMVHRSSEGQTAVIAVLYNIGRSDPFLDKVLANLNDPTKSKEEIDLGVVDPWEIKFGSRKYFRYLGSLTVPPCTEGENSIKEANCST

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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