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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001493`

染色体: Chr06 坐标: 15956769-15957740 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001493`
名称	SmilChr06G001493
描述	uncharacterized SmilChr06G001493
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	15956769 - 15957740 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990569`
GeneID	`130990569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990569`
原始查询	`SmilChr06G001493`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os02g0118800; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`AT4G04650` (AT4G04650) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase)-related family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:825798] identity=21.5; qcov=0.864; evalue=4.23e-10; confidence=weak
Rice	`Os02g0118800` - identity=25.7; qcov=0.929; evalue=5.23e-18; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13966 (zf-RVT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770773.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770773.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770773.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770773.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770773.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:15956789`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B117,C36,D5
`Chr6:15956799`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A4,B46,B84,C29,C79
`Chr6:15956809`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A23,B34,B46,C17,C75
`Chr6:15956820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B50,B77,B80,C13,C86
`Chr6:15956849`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B131,B45
`Chr6:15956862`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,B84,C79
`Chr6:15956894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A3,B46
`Chr6:15956894`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A3,B46
`Chr6:15956897`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B31
`Chr6:15956908`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,B99
`Chr6:15956912`	`TAA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	175	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A2,A21,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B126,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B22,B23,B26,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B88,B89,B90,B92,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C40,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C54,C55,C56,C60,C61,C62,C65,C66,C68,C7,C71,C72,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr6:15956917`	`T`	`TCA`	2bp_insertion	frameshift_variant	169	A1,A10,A11,A14,A16,A18,A2,A21,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B100,B101,B102,B103,B105,B113,B114,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B130,B131,B132,B134,B135,B137,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B22,B23,B27,B28,B29,B3,B33,B34,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B47,B48,B49,B5,B52,B54,B55,B56,B58,B59,B60,B61,B62,B63,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B88,B89,B90,B92,B94,B95,B96,B98,B99,C1,C10,C12,C14,C15,C16,C17,C18,C2,C20,C21,C23,C26,C27,C28,C3,C31,C32,C33,C34,C36,C37,C38,C4,C41,C43,C44,C45,C47,C48,C49,C50,C51,C54,C55,C56,C61,C62,C65,C66,C68,C7,C71,C72,C75,C77,C78,C79,C8,C81,C82,C84,C86,C87,C9,D1,D10,D2,D3,D4,D5,D7,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770773.1

323 aa

162

323

zf-RVT

PF13966 zf-RVT 125-219 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770773.1`	Pfam	`PF13966`	zf-RVT	Domain	125	219	1.2e-19	71.4	zinc-binding in reverse transcriptase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914790.1
ATGGAAAATGGTTGGTGGTCCAAGATCGTTGCAGCGGCTGGGAGGGGAAACGAGGGTTGGTTTTTGGAGAACATCAAACGGAGATTAGGAGATGGGCGAGGTACTAAGTTCTGGGAGGATAGTTGGGTGGGCAGGGAATCCCTTAATATCTCTTTCCATAGGCTTTATCGACTTTGTGAAAATAGGAAGGTTAGCGTTGGTGAGTCGGGAAGGTGGGTTGAAGGGGTGTGGGTTTGGGATTTGAAGTGGCGGAGAGAGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990569
ATGGAAAATGGTTGGTGGTCCAAGATCGTTGCAGCGGCTGGGAGGGGAAACGAGGGTTGGTTTTTGGAGAACATCAAACGGAGATTAGGAGATGGGCGAGGTACTAAGTTCTGGGAGGATAGTTGGGTGGGCAGGGAATCCCTTAATATCTCTTTCCATAGGCTTTATCGACTTTGTGAAAATAGGAAGGTTAGCGTTGGTGAGTCGGGAAGGTGGGTTGAAGGGGTGTGGGTTTGGGATTTGAAGTGGCGGAGAGAGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770773.1
MENGWWSKIVAAAGRGNEGWFLENIKRRLGDGRGTKFWEDSWVGRESLNISFHRLYRLCENRKVSVGESGRWVEGVWVWDLKWRRELRDCERETVKSLMDAISSFVPTAGTKDRWTWRAATDGRYSTKSTYDTIKSKRSVNQNQRSEVKTLVSVWKTAAPQKALVTAWRLLRNRLPTADNLRKRNIMLGDVNQDCPWCHAHGENLNHLFLTCSKAQELWDEIQSWTGISSARPSSAAAHWIVFSECGKEKKVRNLLKTIW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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