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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001505`

染色体: Chr06 坐标: 16082373-16083318 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001505`
名称	SmilChr06G001505
描述	probable F-box protein At5g04010
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16082373 - 16083318 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990187`
GeneID	`130990187`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990187`
原始查询	`SmilChr06G001505`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable F-box protein At5g04010
产物	probable F-box protein At5g04010
Arabidopsis	`AT5G04010` (AT5G04010) F-box family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830280] identity=32.5; qcov=1.02; evalue=2.59e-28; confidence=low
Rice	`Os01g0800900` (Os_F0743) - identity=36.2; qcov=1.08; evalue=7.48e-33; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0009740 (gibberellic acid mediated signaling pathway); GO:0019005 (SCF ubiquitin ligase complex); GO:0031146 (SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990187

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770396.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770396.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770396.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770396.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770396.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16082561`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A14,A18,B120
`Chr6:16082563`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B28
`Chr6:16082563`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B28
`Chr6:16082564`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B28
`Chr6:16082564`	`CAA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	B28
`Chr6:16082695`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	12	B122,B132,B133,B140,B77,B8,C3,C39,C42,C48,C7,C77
`Chr6:16082907`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B9,C38
`Chr6:16082913`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:16082928`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr6:16082931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:16082978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:16083086`	`CTG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	B69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770396.1

248 aa

124

248

F-box-like

PF12937 F-box-like 11-48 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770396.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	11	48	3.6e-06	27.3	F-box-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914413.1
TTTGATTTTATTTATTTGCTCGAAGCAGCAACATCAAAAACAACTAATCCGCATTTTCTTTAGTAACAAAAGATACTGTGCGAAAAATTTCAGATAAACAACGCTTGGCGAAATCTTAATTAGAATGATGAAAAAGAGGTCTCCGCCGTGGCAAGTTCTTGATCTCGTGGCCCACCGCCTCGACGCCGAAACCCTCGCCACCGCCGCCTGCGTATGCAAATCCTGGTCCACAGCCATGTCCGCCGACCACCTCTGGCAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990187
ATGATGAAAAAGAGGTCTCCGCCGTGGCAAGTTCTTGATCTCGTGGCCCACCGCCTCGACGCCGAAACCCTCGCCACCGCCGCCTGCGTATGCAAATCCTGGTCCACAGCCATGTCCGCCGACCACCTCTGGCAGCCCATCTGCTCCGCCGTCTACCCCTCTCTCTCCAACCTCCACCCCACCGGCGTTGTCCCCTACCGCCGGCTCTACGCCCTCGGCCGCGCCGCCGAGAAGCGCCGCCTCCGGAGCCCCCCCAAGCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770396.1
MMKKRSPPWQVLDLVAHRLDAETLATAACVCKSWSTAMSADHLWQPICSAVYPSLSNLHPTGVVPYRRLYALGRAAEKRRLRSPPKPTLSMRDLVFAVDVHNGRGCVATVVSPGGGLQPNKGSGVFQFDIGVDGGNMVAFEELDSLRITWNVVLQGLKGVFTMMDCRGKGSFVLGLEGWFSKELPPPGCCSGGAASGLVADLRLGLRESVAGKVVVEKISVGVLSIVSWRYVCIDDALRYLQHFLLPS

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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