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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001508`

染色体: Chr06 坐标: 16109202-16113884 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001508`
名称	SmilChr06G001508
描述	N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein gpi1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16109202 - 16113884 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990190`
GeneID	`130990190`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990190`
原始查询	`SmilChr06G001508`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein gpi1-like
产物	N-acetylglucosaminyl-phosphatidylinositol biosynthetic protein gpi1-like
Arabidopsis	`AT3G57170` (AT3G57170) N-acetylglucosaminyl transferase component family protein / Gpi1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824884] identity=45.2; qcov=0.756; evalue=1.45e-140; confidence=high
Rice	`Os05g0290300` - identity=48.1; qcov=0.293; evalue=2.48e-50; confidence=weak
GO	GO:0006506 (GPI anchor biosynthetic process); GO:0016020 (membrane)
KEGG	smil00563 (Glycosylphosphatidylinositol (GPI)-anchor biosynthesis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF05024 (Gpi1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990190

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057770399.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.80000	`XP_057770399.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.40000	`XP_057770399.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770399.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770399.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16109462`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B38,B46,B52
`Chr6:16110791`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B120
`Chr6:16110822`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A15,A19,B11,B123,B137,B138,B139,B15,B23,B29,B32,B37,B41,B58,B65,B73,B84,B89,C16,C24,C3,C4,C5,C51,C74,C80
`Chr6:16111151`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C27,D4
`Chr6:16111183`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B99,C30,C44,C75
`Chr6:16111200`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:16111264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C34,C75
`Chr6:16112044`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,C27,D4
`Chr6:16112185`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A18,B50,B80,C48
`Chr6:16112201`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B11,C22
`Chr6:16113025`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B136
`Chr6:16113040`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770399.1

724 aa

362

724

Gpi1

PF05024 Gpi1 320-592 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770399.1`	Pfam	`PF05024`	Gpi1	Family	320	592	2.8e-75	253.9	N-acetylglucosaminyl transferase component (Gpi1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914416.1
ACATTGGTTAATAGGTTGGTGCGTTATGGCGGGAAAATGGTTTGGTGTGGATGTACTCAGCTTTTATATATATATATAAATATAAATATAAATAAATAGATATAGATTTGACGGCCGCCGCGCACCCAAATTCCTCCGCCGGCCGCCGCCAACATCTACAGAAGATCGCGCTTTTCCGGATATCACAGTTCTACGACAAATGACGCGCGCCGATTGAGGTGTAACAATGGCAAGGAGAGGGAATTGCAGGCTGTGGTGGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990190
ATGGCAAGGAGAGGGAATTGCAGGCTGTGGTGGCCTGCTGATCTCTTTTCTCAAACTCCGCCGGATTCAAGTTTCTTATTTGGATGGTTCCTTCCCTCTTCCGAAGCTTCCATCGATGTTGTTGTGGCTTTCGCTTGCGATCAGCACAAACTTGCTTCTTCACTTGAATCCGGTTTGGATCTCATGGAAATCCTTCGTACGACGAACAAGAACATGCCTACACTTCTTCAAGAGAAAAGCGGCTTCTCTCTTCTGGGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770399.1
MARRGNCRLWWPADLFSQTPPDSSFLFGWFLPSSEASIDVVVAFACDQHKLASSLESGLDLMEILRTTNKNMPTLLQEKSGFSLLGYFEGDCSGNGKLVNCGNDRNRDMTLNGNQSSSSLVSNQESWSCGCLRHDSILGHGRLATPENLSIKLVYVRSDGMDGRVLAIPKLDHLHLNGKIESHLDLHVIFYEIPNFGGHHYSLGAHFSSNLVASPSMKPKWFEDLHQRDSHLDLDIVIQAINSANAAQILFDGHHHAESG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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