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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001512`

染色体: Chr06 坐标: 16182404-16184746 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001512`
名称	SmilChr06G001512
描述	nuclear intron maturase 3, mitochondrial
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16182404 - 16184746 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990194`
GeneID	`130990194`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990194`
原始查询	`SmilChr06G001512`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear intron maturase 3, mitochondrial
产物	nuclear intron maturase 3%2C mitochondrial
Arabidopsis	`AT5G04050` (AT5G04050) RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830284] identity=56.6; qcov=0.772; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0659200` - identity=62.6; qcov=0.217; evalue=7.61e-72; confidence=weak
GO	GO:0006397 (mRNA processing)
KEGG	-
Pfam	PF01348 (Intron_maturas2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990194

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770401.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770401.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770401.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770401.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770401.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16182719`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B77
`Chr6:16182825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B103,B46,B52
`Chr6:16182875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B90,B92
`Chr6:16183322`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B64,B90,B92
`Chr6:16183430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:16183515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C24
`Chr6:16183515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24
`Chr6:16183733`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16183793`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:16183794`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,D3
`Chr6:16183988`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B90,B92
`Chr6:16184123`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B90,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770401.1

764 aa

382

764

Intron_maturas2

PF01348 Intron_maturas2 537-634 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770401.1`	Pfam	`PF01348`	Intron_maturas2	Domain	537	634	2e-14	54.5	Type II intron maturase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914418.1
TCCAACTTTTTCTAAATTACAAATGTTCGCTAACTTTCTCCGGAAACCCAGAGTCGCCGCCATCGCCGCCACCGCCGCCACCACTGCTGTGAAACCCTCCCTCTTTTCCACCCTCCAACACCCGCCAACAGAAATCCGACCTCTCGAAAAATCAGCTCTCCAATCACTAGTCCTCTCCCACTATCGCCACGGCAAATTCCAGAGCCTCCTCCAAAACATCGTCGCTTCACCCTCCCTCCTCCTCACCGCCTGCCACAACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990194
ATGTTCGCTAACTTTCTCCGGAAACCCAGAGTCGCCGCCATCGCCGCCACCGCCGCCACCACTGCTGTGAAACCCTCCCTCTTTTCCACCCTCCAACACCCGCCAACAGAAATCCGACCTCTCGAAAAATCAGCTCTCCAATCACTAGTCCTCTCCCACTATCGCCACGGCAAATTCCAGAGCCTCCTCCAAAACATCGTCGCTTCACCCTCCCTCCTCCTCACCGCCTGCCACAACCTCCGAAAGCATGCCCCCGACTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770401.1
MFANFLRKPRVAAIAATAATTAVKPSLFSTLQHPPTEIRPLEKSALQSLVLSHYRHGKFQSLLQNIVASPSLLLTACHNLRKHAPDSPPPPLTLDSVSTHFFSLQELSSQLANNSVDVESCCISVFPKSRKGEALVLPNLKLKVVLEAIRIVLEVIYDDRFVTFCYGGRANMGRHTAIRYLKNSVENPNWWFSVKFDDQLFQSRHVGNLCLMLGQKIDDCDFLDLIRRLFGCRVVSVNLGGVCLGRGLPQECALSSILIN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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