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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001515`

染色体: Chr06 坐标: 16254121-16256414 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001515`
名称	SmilChr06G001515
描述	two-component response regulator ORR9-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16254121 - 16256414 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990197`
GeneID	`130990197`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990197`
原始查询	`SmilChr06G001515`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	two-component response regulator ORR9-like
产物	two-component response regulator ORR9-like
Arabidopsis	`AT3G57040` (ARR9) response regulator 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824871] identity=59.4; qcov=1.02; evalue=3.23e-89; confidence=high
Rice	`Os12g0139400` (RR10) - identity=58.5; qcov=0.969; evalue=3.79e-79; confidence=high
GO	GO:0000160 (phosphorelay signal transduction system); GO:0009736 (cytokinin-activated signaling pathway)
KEGG	smil04075 (Plant hormone signal transduction - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00072 (Response_reg)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990197

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770406.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770406.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770406.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770406.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770406.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16254484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:16254648`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C37
`Chr6:16255970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B4,C14
`Chr6:16255971`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770406.1

224 aa

112

224

Response_reg

PF00072 Response_reg 12-139 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770406.1`	Pfam	`PF00072`	Response_reg	Domain	12	139	1.2e-19	71.2	Response regulator receiver domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914423.1
AATTAGATAAATAAATAAATAAACGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGGGTAGTAGTATTATTTAGTTGTGTTGAATTGTATAGATAGAAAAATGTACAATCCCACGTTCAAAGATTAGTTTTCCCACTATTCTTTATTCTTTCTAATCTGTATTGCTTGCCTTGCAGTTCAATTCCAAGCTGGAAATATATTGCAACAAAATCTTTGGTAGAAATCTGGTCAGATCTTGCCTTCTGCTCTTCTTCATTTTGCTTCATTACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990197
ATGGCCATAGCAGCAGCAGATGATCAGTTTCATGTTCTTGCTGTTGATGACAGCTTGATTGACAGAAAGCTGATTGAGAGGCTTCTCAAGACATCCTCTTTCCAAGTCACCACAGTTGATTCTGGTAGCAAAGCTTTGGAATTTCTTGGTTGGCATGAAACTGAGAGAAACATGTTCAATGAAACCTCCATTTCTCCCAAGAATCATCAGGAAGTGGAAGTGAATCTTGTTATTACAGACTATTGTATGCCTGGTATGAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770406.1
MAIAAADDQFHVLAVDDSLIDRKLIERLLKTSSFQVTTVDSGSKALEFLGWHETERNMFNETSISPKNHQEVEVNLVITDYCMPGMTGYDLLKKIKESAILRDIPVVIMSSENVPSRITRCLEEGAEEFFLKPMKLSDVNKLRPHMMRSKSKNENEKQEKQENEEIISRGEADSDMQTAQSLQQQTSQANNNNSVDNNKRKSIDEGLSPDRTRPRYSDLTVMSN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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