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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001538`

染色体: Chr06 坐标: 16636174-16638340 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001538`
名称	SmilChr06G001538
描述	uncharacterized SmilChr06G001538
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16636174 - 16638340 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990217`
GeneID	`130990217`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990217`
原始查询	`SmilChr06G001538`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824695]; symbol=AT3G55290; hit=AT3G55290; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824695]; symbol=AT3G55290; hit=AT3G55290; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G55290` (AT3G55290) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824695] identity=62.2; qcov=0.993; evalue=1.8e-133; confidence=high
Rice	`Os08g0510400` - identity=65.1; qcov=0.949; evalue=3.94e-123; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990217

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057770429.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770429.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770429.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770429.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770429.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16636301`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr6:16636513`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	6	A19,B105,B110,B134,C50,D6
`Chr6:16636535`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	32	A18,B113,B122,B13,B132,B133,B140,B15,B16,B25,B70,B74,B8,B83,B85,B94,C12,C3,C30,C35,C45,C46,C48,C49,C59,C64,C66,C7,C71,C77,D1,D7
`Chr6:16636540`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B17,C23
`Chr6:16636550`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:16637215`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:16637223`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B119
`Chr6:16637262`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B31,B59,B86,C72
`Chr6:16637305`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A13,A14,B59
`Chr6:16638007`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:16638017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B140,B32

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770429.1

293 aa

146

293

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 22-233 aa PF08659 KR 24-198 aa PF13561 adh_short_C2 28-283 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770429.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	22	233	6.2e-51	173.4	short chain dehydrogenase
`XP_057770429.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	24	198	7.4e-07	30.0	KR domain
`XP_057770429.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	28	283	1.6e-43	149.7	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914446.1
TTTAAATTAGAGAATCAGACGTCTCTCTCTAGAACAGAAATGTCGTCGGCAAGCAGAAGCGAGGTGGCTTCCAGCTTGGAGCCGTGGCTTCAGCTTAACAACAAAGTCGTGATGGTGACCGGCGCGTCGTCGGGGCTGGGCCGAGAATTCTGCTTAGACTTGGCCAAATCTGGCTGTAGAATCTTAGCCGCCGCTCGACGAGTCGACCGATTACAATCGCTTTGCCATGAAATCAACAACCGCATCGGCTCGGCCGATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990217
ATGTCGTCGGCAAGCAGAAGCGAGGTGGCTTCCAGCTTGGAGCCGTGGCTTCAGCTTAACAACAAAGTCGTGATGGTGACCGGCGCGTCGTCGGGGCTGGGCCGAGAATTCTGCTTAGACTTGGCCAAATCTGGCTGTAGAATCTTAGCCGCCGCTCGACGAGTCGACCGATTACAATCGCTTTGCCATGAAATCAACAACCGCATCGGCTCGGCCGATTCGAACGAGCCTGGATACGGCCGAGATCGAGCTCGAGCCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770429.1
MSSASRSEVASSLEPWLQLNNKVVMVTGASSGLGREFCLDLAKSGCRILAAARRVDRLQSLCHEINNRIGSADSNEPGYGRDRARAVPLELDVSASAATVEAAVEKAWDAFGRIDVLINNAGIRGSVHTPLNLSEDEWDSVIKTNLKGTWLVSKYVCARMRDAREGGSVINISSTAGLNRGHLPGSLIYATSKAAVNSMTKVMALELGAYKIRVNSISPGIFKSEITESLIQKDWLKTVAFKTIPLRTHGKSDPALTSLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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