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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001540`

染色体: Chr06 坐标: 16650841-16651401 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001540`
名称	SmilChr06G001540
描述	uncharacterized SmilChr06G001540
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16650841 - 16651401 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990577`
GeneID	`130990577`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990577`
原始查询	`SmilChr06G001540`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os08g0315200; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os08g0315200` - identity=36.2; qcov=0.758; evalue=1.87e-21; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03732 (PEG10_N-capsid); PF19259 (Ty3_capsid)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990577

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770781.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057770781.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057770781.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057770781.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770781.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16650849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,C43
`Chr6:16650858`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,B63,D10
`Chr6:16650922`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	A6,B130,B96,C19,C29,C68
`Chr6:16650937`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	12	A2,A7,B39,B44,B51,B55,B66,B90,B92,C18,C2,C37
`Chr6:16650941`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B136,B74,B81,C13,C42
`Chr6:16650941`	`AC`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B136,B74,B81,C13,C42
`Chr6:16650943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B40,B43,C19
`Chr6:16650950`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B47
`Chr6:16650954`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B104
`Chr6:16650954`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B104
`Chr6:16650970`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,B90,B92
`Chr6:16650982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B127,B128,B31,B44,B76,C79,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770781.1

186 aa

186

Ty3_capsid

PEG10_N-capsid

PF19259 Ty3_capsid 46-186 aa PF03732 PEG10_N-capsid 51-130 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770781.1`	Pfam	`PF19259`	Ty3_capsid	Domain	46	186	1.8e-08	34.7	Ty3 transposon capsid-like protein
`XP_057770781.1`	Pfam	`PF03732`	PEG10_N-capsid	Domain	51	130	1.1e-14	55.3	Retrotransposon-derived protein PEG10, N-terminal capsid-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914798.1
ATGCCACCCCGTAGAGCCCCTACCGATCAACAAAACGGGATGCAAGAATTTATCGCCGCAATGCAAGGATTCTTTCAACAACAAGCTCAAGGTGCGCAAAACCCACAACGCAATAACACAAGCGTAGTCGTAGAGCAGTTCCGACGTTATAATCCACCAAGATTTGACGGGAGGAGCGGACCCCTAGCAATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAGAGAATATTTGAACATATCGAGTGCACCGATGCCCACAACGTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990577
ATGCCACCCCGTAGAGCCCCTACCGATCAACAAAACGGGATGCAAGAATTTATCGCCGCAATGCAAGGATTCTTTCAACAACAAGCTCAAGGTGCGCAAAACCCACAACGCAATAACACAAGCGTAGTCGTAGAGCAGTTCCGACGTTATAATCCACCAAGATTTGACGGGAGGAGCGGACCCCTAGCAATGGAGGAATGGATAAGAGAGCTGGAGAGAATATTTGAACATATCGAGTGCACCGATGCCCACAACGTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770781.1
MPPRRAPTDQQNGMQEFIAAMQGFFQQQAQGAQNPQRNNTSVVVEQFRRYNPPRFDGRSGPLAMEEWIRELERIFEHIECTDAHNVSCALFQLCEDASHWWESFKQSMTEQARQGLTWNRFKEIVTNQYFPRPYRNQKEAEFLDLKQGGLSITDYERKFNQLSRYATRLVNTNDQKADRFLRGLRP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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