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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001543`

染色体: Chr06 坐标: 16703286-16705186 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001543`
名称	SmilChr06G001543
描述	uncharacterized SmilChr06G001543
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16703286 - 16705186 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990220`
GeneID	`130990220`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990220`
原始查询	`SmilChr06G001543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644]; symbol=AT1G63380; hit=AT1G63380; species=arabidopsis; confidence=high
产物	NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644]; symbol=AT1G63380; hit=AT1G63380; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G63380` (AT1G63380) NAD(P)-binding Rossmann-fold superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:842644] identity=61.4; qcov=1; evalue=8.45e-127; confidence=high
Rice	`Os08g0510400` - identity=66; qcov=0.964; evalue=8.86e-116; confidence=high
GO	GO:0016491 (oxidoreductase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990220

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Peroxisome	过氧化物酶体	1.00000	`XP_057770431.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057770431.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770431.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770431.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770431.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16703654`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:16703810`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:16703921`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B113
`Chr6:16703962`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B27
`Chr6:16703962`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B27
`Chr6:16704833`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:16704864`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B101
`Chr6:16704961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,C61
`Chr6:16705004`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B14,C34,C75
`Chr6:16705011`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr6:16705014`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770431.1

281 aa

140

281

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 18-221 aa PF08659 KR 20-189 aa PF13561 adh_short_C2 24-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770431.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	18	221	4e-49	167.5	short chain dehydrogenase
`XP_057770431.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	20	189	1.4e-08	35.6	KR domain
`XP_057770431.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	24	271	7.8e-45	154.0	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914448.1
CAACCCTCGTGTACTCATTGTCACAGCTGCTACCACAAATCTCTCATCCTCGTATAAGGAAAATGGCTACTGAAATCCTACACCAATTGGAGCCATGGTCTCACCTCGACGGAAAAATCGTCATGGTCACCGGGGCCTCCTCGGGCCTCGGCTACGAGTTCTGCCTCGATCTCGCCAAGGCCGGCTGCAGAGTCGTAGCCGCGGCCCGTAGAACCGACCGCCTCAGGTCCCTCTGCGATCAAATCAATGCAATGGACGCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990220
ATGGCTACTGAAATCCTACACCAATTGGAGCCATGGTCTCACCTCGACGGAAAAATCGTCATGGTCACCGGGGCCTCCTCGGGCCTCGGCTACGAGTTCTGCCTCGATCTCGCCAAGGCCGGCTGCAGAGTCGTAGCCGCGGCCCGTAGAACCGACCGCCTCAGGTCCCTCTGCGATCAAATCAATGCAATGGACGCTCCCAACGGCAGCAGCTCGTGTCGAGCTATCGCGGTGGAGCTCGACGTCTCCGCTGGCGGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770431.1
MATEILHQLEPWSHLDGKIVMVTGASSGLGYEFCLDLAKAGCRVVAAARRTDRLRSLCDQINAMDAPNGSSSCRAIAVELDVSAGGPAIAASVERAWAAFGSINALINNAGVRGQVRSSIDLSEEEWNSVVKTNLNGSWLVSKYVGERMRSTAGGSIINISSVSGLNRSTFRGGVAYGASKAGLDYMTKAMALELGDYNIRVNSIAPGVFKSEITEDLLQKNWMKNVAEKSVPLKTFGTSDPALTSLIRYLIHHSSSYVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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