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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001555`

染色体: Chr06 坐标: 16940696-16941259 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001555`
名称	SmilChr06G001555
描述	uncharacterized SmilChr06G001555
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	16940696 - 16941259 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990581`
GeneID	`130990581`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990581`
原始查询	`SmilChr06G001555`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os06g0597250; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=48.2; qcov=0.765; evalue=5.64e-29; confidence=medium
Rice	`Os06g0597250` - identity=49.7; qcov=0.882; evalue=8.53e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran); PF28509 (DUF8418)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990581

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770786.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770786.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770786.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770786.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770786.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:16940715`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	30	A16,A8,B103,B104,B109,B111,B121,B122,B123,B127,B129,B16,B18,B3,B70,B71,C11,C14,C18,C2,C28,C32,C62,C63,C64,C67,C69,C81,C83,D1
`Chr6:16940729`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C8
`Chr6:16940786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:16940838`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A13,A16,B50,B60,B88
`Chr6:16940840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	A18,B120
`Chr6:16940840`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B120
`Chr6:16940849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	B106,B126,B135,B23,C35,C64,C66
`Chr6:16940871`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B132
`Chr6:16940874`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:16940875`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C13
`Chr6:16940878`	`A`	`AT`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B47,C23
`Chr6:16940878`	`A`	`AT`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B47,C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770786.1

187 aa

187

DUF8418

Plant_tran

PF28509 DUF8418 31-70 aa PF04827 Plant_tran 139-187 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770786.1`	Pfam	`PF28509`	DUF8418	Domain	31	70	3.9e-13	49.6	Domain of unknown function (DUF8418)
`XP_057770786.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	139	187	1.8e-15	57.8	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914803.1
ATGCAAGTAGCGAGTTATTATCGTTTCAATCCTCCTCATCTACCGAAGAAGAAGCGTAAAGTTGTTCTTGTTCTCCGTGATCGTGAAGGTGGTGGCGAGCGCTTCCATCGGGATTATTTTGCTCCCGATGCAGTTTGTGGGCCGCAATTTTTCCGACGTCATTTATGTATGAGTCGGGCGTTATTTCTACGCATTGTGAATGCACTAGAAGTCGATCTTTACTTCCAACAACATCCCGATGCTTGTGGCCGCATTGGCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990581
ATGCAAGTAGCGAGTTATTATCGTTTCAATCCTCCTCATCTACCGAAGAAGAAGCGTAAAGTTGTTCTTGTTCTCCGTGATCGTGAAGGTGGTGGCGAGCGCTTCCATCGGGATTATTTTGCTCCCGATGCAGTTTGTGGGCCGCAATTTTTCCGACGTCATTTATGTATGAGTCGGGCGTTATTTCTACGCATTGTGAATGCACTAGAAGTCGATCTTTACTTCCAACAACATCCCGATGCTTGTGGCCGCATTGGCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770786.1
MQVASYYRFNPPHLPKKKRKVVLVLRDREGGGERFHRDYFAPDAVCGPQFFRRHLCMSRALFLRIVNALEVDLYFQQHPDACGRIGFSPIQKCTAAIWQLAYGTAADCCDEYLHIGEMIALACLKKFCKAVVRIFSGVYLRRPTTVDVQRLTVMNEARHGFPGMLGRLDFMHWAWKNCPVAWHGTYT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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