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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001572`

染色体: Chr06 坐标: 17164366-17171234 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001572`
名称	SmilChr06G001572
描述	4-alpha-glucanotransferase DPE2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17164366 - 17171234 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990245`
GeneID	`130990245`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990245`
原始查询	`SmilChr06G001572`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	4-alpha-glucanotransferase DPE2
产物	4-alpha-glucanotransferase DPE2
Arabidopsis	`AT2G40840` (DPE2) disproportionating enzyme 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818682] identity=71.8; qcov=0.948; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0662900` (OsDPE2) - identity=70.2; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004134 (4-alpha-glucanotransferase activity); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process); GO:2001070 (starch binding)
KEGG	smil00500 (Starch and sucrose metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00686 (CBM_20); PF02446 (Glyco_hydro_77)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990245

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770458.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770458.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057770458.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770458.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770458.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17164607`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:17164700`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B118,B30,B67,C63
`Chr6:17164704`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B33,B34,B98,C85
`Chr6:17164767`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C75
`Chr6:17165089`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:17165093`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:17165403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr6:17165467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr6:17166049`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C17
`Chr6:17166472`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B35,B80
`Chr6:17166860`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:17167328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B104,B47,D10,D7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770458.1

968 aa

484

968

CBM_20

Glyco_hydro_77

PF00686 CBM_20 16-107 aa PF00686 CBM_20 160-248 aa PF02446 Glyco_hydro_77 272-900 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770458.1`	Pfam	`PF00686`	CBM_20	Family	16	107	3e-35	120.6	Starch binding domain
`XP_057770458.1`	Pfam	`PF00686`	CBM_20	Family	160	248	3e-35	120.6	Starch binding domain
`XP_057770458.1`	Pfam	`PF02446`	Glyco_hydro_77	Domain	272	900	7e-146	487.4	4-alpha-glucanotransferase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914475.1
ACCTGTCAGCTTCTAACCTAGCGCAGCAATTTGAGGAGGGGGGTTTTCAATTCTTTTTTGCTTCACATGGCAAAATATCTCATCTTTTTTTATGTTCGTCACAACCCTATAAAAAATCTTCCAAAATAAATTCTTGACAAATAAATATAATGCTCGCTCTTTTCGCTATTGCAAGACCCACCGTCTGATTCTTCCTCCATTCTCTCCTCTCGTCTTCTTCAAGAGTTAGCAAGAAAAGAGTTGGAATCTTGGCAAGGAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990245
ATGTCAAACCTGAGTCTGTTTCTTGGGAGCAAGCCGTCAAATTCGGTGATTGTCAGCTTCAGAATACCATACTTCACCCACTGGGGGCAGCAGATACTGGTGTGTGGCTCTGAACGCGTCCTAGGCTCATGGGATGTGAAGAAAGGTCTTCTGTTGAGGCCTTCCCACCATGGGGACGAGCTGATATGGTGTGGTAGTCTTTCTGTCCCTGCTGGTTTTACTTGTGAGTACAGCTATTACGTAGTGGATGATAACAAGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770458.1
MSNLSLFLGSKPSNSVIVSFRIPYFTHWGQQILVCGSERVLGSWDVKKGLLLRPSHHGDELIWCGSLSVPAGFTCEYSYYVVDDNKNVIRWEAGKKRKMSLPDSAQHGQLVELHDLWQTGSDDLVLRSAFKNVIFRTSASLKIERPLESVQNVLDNEDSVVVQFRICCPNIEDDTSVYVIGSTLKLGQWKTEGALKLSYAGESVWVAESVMKKDEFPVKYRYCKYGKAKKLALEIGANRELSVDFSASQPKYIILSDGQI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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