当前解析结果
SmilChr06G001581| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001581 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001581 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001581 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 17241977 - 17243067 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990587 |
|---|---|
| GeneID | 130990587 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990587 |
| 原始查询 | SmilChr06G001581 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990587 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770792.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770792.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770792.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770792.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770792.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:17242621 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B107,B84,C46,C83 |
Chr6:17242636 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 20 | A23,A24,B102,B119,B136,B24,B26,B33,B36,B4,B72,B74,B81,C13,C37,C40,C42,C84,D10,D11 |
Chr6:17242667 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B1,B64,B73,C84,D9 |
Chr6:17242677 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B73,C78,C84,D9 |
Chr6:17242784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B17,D7 |
Chr6:17242784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,D7 |
Chr6:17242818 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B40,B42,B54,C54,C69 |
Chr6:17242824 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B42,B54 |
Chr6:17242845 |
CAG |
C |
2bp_deletion | frameshift_variant | 47 | A13,A19,A3,A4,A7,A9,B1,B103,B104,B105,B113,B119,B12,B121,B122,B138,B36,B42,B43,B46,B48,B5,B59,B62,B66,B69,B78,B84,B88,B89,B91,B96,C16,C17,C22,C34,C40,C53,C56,C59,C72,C74,C76,C81,C87,C9,D5 |
Chr6:17242848 |
T |
TCC |
2bp_insertion | frameshift_variant | 48 | A13,A19,A3,A4,A7,A9,B1,B103,B104,B105,B113,B119,B12,B121,B122,B138,B36,B42,B43,B46,B48,B5,B59,B62,B66,B69,B78,B84,B88,B89,B90,B91,B96,C16,C17,C22,C34,C40,C53,C56,C59,C72,C74,C76,C81,C87,C9,D5 |
Chr6:17242860 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B17,B46 |
Chr6:17242861 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B34,B54 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。