当前解析结果
SmilChr06G001583| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001583 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001583 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001583 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 17243175 - 17245423 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130990256 |
|---|---|
| GeneID | 130990256 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990256 |
| 原始查询 | SmilChr06G001583 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990256 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770473.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057770473.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770473.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770473.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770473.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:17243186 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B14,B53,B80 |
Chr6:17243195 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr6:17243204 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B1 |
Chr6:17243208 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A13,A8,A9,B109,B111,B114,B117,B122,B123,B128,B129,B133,B137,B18,B21,B31,B5,B54,B6,B85,B87,B9,C11,C28,C50,C54,C67,C69,C76,C84,D8 |
Chr6:17243227 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr6:17243263 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,B68 |
Chr6:17243270 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C13,C76 |
Chr6:17243274 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B104,B35 |
Chr6:17243283 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D7 |
Chr6:17243384 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr6:17243394 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | A11,B33,B68 |
Chr6:17243414 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 16 | A15,B11,B129,B20,B32,B36,B50,B93,B98,C24,C25,C26,C33,C42,C63,C76 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。