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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001586`

染色体: Chr06 坐标: 17331753-17332752 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001586`
名称	SmilChr06G001586
描述	uncharacterized SmilChr06G001586
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17331753 - 17332752 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990588`
GeneID	`130990588`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990588`
原始查询	`SmilChr06G001586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=38.3; qcov=0.756; evalue=6.82e-32; confidence=medium
Rice	`Os01g0872900` - identity=54; qcov=0.394; evalue=1.06e-22; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990588

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770793.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770793.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770793.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770793.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770793.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17331770`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:17331850`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,B103,C38
`Chr6:17331882`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	130	A1,A11,A13,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A5,A6,B100,B102,B103,B104,B105,B106,B109,B110,B113,B114,B115,B119,B120,B122,B123,B124,B125,B129,B130,B131,B14,B16,B17,B19,B2,B20,B22,B24,B26,B33,B34,B36,B4,B40,B41,B45,B46,B49,B5,B50,B53,B54,B55,B58,B60,B65,B66,B71,B72,B73,B74,B76,B77,B78,B79,B8,B81,B82,B86,B90,B92,B94,B98,B99,C10,C11,C14,C16,C17,C20,C21,C22,C23,C26,C29,C3,C30,C33,C34,C36,C37,C40,C42,C43,C45,C46,C47,C48,C49,C51,C52,C58,C60,C65,C69,C7,C71,C72,C74,C75,C77,C78,C79,C81,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D10,D11,D3,D4,D5,D6
`Chr6:17331904`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B103
`Chr6:17331932`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B59
`Chr6:17331943`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B48,B59,C59
`Chr6:17331992`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B36,B74,C42
`Chr6:17331994`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A5,B104,B60,B80,D5
`Chr6:17332278`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,C69
`Chr6:17332288`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B52,B97,B98
`Chr6:17332309`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:17332312`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770793.1

221 aa

110

221

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 83-166 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770793.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	83	166	6.2e-26	92.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914810.1
ATGCATAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGATGTGTGCCGGGATTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATGCACGGTGGCTATCCGCCAATTAGCTACCGGCTTAAGTGCGGATACTTTGGACGAGTATCTCAAGGTCGCCGACACGACGGGGCATCTATGCCTAAACAAATTTTGCAGAGCTGTCATCCGGGCATACGGTGTCAATTCGAACAACGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990588
ATGCATAAGGAGTTGTTCTTGCGCATCGTCGATGCTGTGCAAGGTGAAGATGGTTACTTCCGGATGAGCCATGATGATGTGTGCCGGGATTCTCTCACGCCTTTGCAGAAATGCACGGTGGCTATCCGCCAATTAGCTACCGGCTTAAGTGCGGATACTTTGGACGAGTATCTCAAGGTCGCCGACACGACGGGGCATCTATGCCTAAACAAATTTTGCAGAGCTGTCATCCGGGCATACGGTGTCAATTCGAACAACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770793.1
MHKELFLRIVDAVQGEDGYFRMSHDDVCRDSLTPLQKCTVAIRQLATGLSADTLDEYLKVADTTGHLCLNKFCRAVIRAYGVNSNNDINVLNQSPLFSDVLEGTSAPVIFEANQHYYQMGYYLCDDIYSEWRCFVKSPPMATNPKEVRFKKMQESAWKDIERAFGNMIVENEGQGATHWRDDDAGHEASSSDSTESARTTPPRFEEYVLRDALLRDRQIHA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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