当前解析结果
SmilChr06G001592| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001592 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001592 |
| 描述 | glutathione S-transferase T3-like |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 17592979 - 17593962 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990589 |
|---|---|
| GeneID | 130990589 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990589 |
| 原始查询 | SmilChr06G001592 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | glutathione S-transferase T3-like |
| 产物 | glutathione S-transferase T3-like |
| Arabidopsis | AT3G47680 (AT3G47680)DNA binding protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823922] identity=27.3; qcov=0.841; evalue=2.9e-11; confidence=low |
| Rice | Os06g0635500- identity=25.9; qcov=0.838; evalue=4.76e-10; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990589 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770794.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770794.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770794.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770794.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057770794.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:17593211 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B23,B74,B94,C75 |
Chr6:17593226 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C5 |
Chr6:17593443 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B91,C32,C9 |
Chr6:17593455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | A1,B110,B36,B88 |
Chr6:17593455 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | A1,B110,B36,B88 |
Chr6:17593461 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B95 |
Chr6:17593487 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B28,C15,C40 |
Chr6:17593488 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A7,B137,B48,B60,B96 |
Chr6:17593497 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 14 | A1,A23,A9,B119,B23,B36,B49,B55,B59,B81,B88,C11,C19,C75 |
Chr6:17593499 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B131,B53,B89,B99,C83 |
Chr6:17593500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | B69,B70 |
Chr6:17593500 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B69,B70 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。