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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001609`

染色体: Chr06 坐标: 17934423-17935415 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001609`
名称	SmilChr06G001609
描述	uncharacterized SmilChr06G001609
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	17934423 - 17935415 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990594`
GeneID	`130990594`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990594`
原始查询	`SmilChr06G001609`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
产物	hit=Os10g0351414; species=rice; confidence=low
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os10g0351414` - identity=28.4; qcov=0.982; evalue=2.59e-34; confidence=low
GO	GO:0003824 (catalytic activity)
KEGG	-
Pfam	PF03372 (Exo_endo_phos)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990594

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770800.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057770800.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057770800.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770800.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770800.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:17934423`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B40,B66,C17,C25,C8
`Chr6:17934423`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B40,B66,C17,C25,C8
`Chr6:17934445`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B52,B75,D7,D8
`Chr6:17934450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,B52,B75,D7,D8
`Chr6:17934466`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	3	A24,A5,B104
`Chr6:17934466`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	3	A24,A5,B104
`Chr6:17934482`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B50,C53,C58,C78
`Chr6:17934484`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,D10
`Chr6:17934515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B85,C2,C55
`Chr6:17934602`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:17934675`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:17934768`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B28,C7

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770800.1

330 aa

165

330

Exo_endo_phos

PF03372 Exo_endo_phos 5-228 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770800.1`	Pfam	`PF03372`	Exo_endo_phos	Domain	5	228	1.2e-12	48.7	Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914817.1
ATGAATTGTTTACTGTGGAATTGTCGAGGGCTTGAGAACCAATCGACAATTCGGCAACTTGTTTGGCTTGTCAAACAAAAGAGACCCGACTTGGTTTTCCTTATGGAAACCAAGCTTTTTATGGAAGAATGGAATTCTATTTTAGTTTCTGTGGGTTTGGAAAATTCGTTTGTGGTAGAGTGTGATCACTTGGCTGTTGGGAGAAGAGGAGGTTTATGTCTCTTATGGTCGGAAAATGTTGATGTTCACGTGAAGTCTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990594
ATGAATTGTTTACTGTGGAATTGTCGAGGGCTTGAGAACCAATCGACAATTCGGCAACTTGTTTGGCTTGTCAAACAAAAGAGACCCGACTTGGTTTTCCTTATGGAAACCAAGCTTTTTATGGAAGAATGGAATTCTATTTTAGTTTCTGTGGGTTTGGAAAATTCGTTTGTGGTAGAGTGTGATCACTTGGCTGTTGGGAGAAGAGGAGGTTTATGTCTCTTATGGTCGGAAAATGTTGATGTTCACGTGAAGTCTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770800.1
MNCLLWNCRGLENQSTIRQLVWLVKQKRPDLVFLMETKLFMEEWNSILVSVGLENSFVVECDHLAVGRRGGLCLLWSENVDVHVKSSSPHHILAEINENGNPPWDFAGIYRWSNTSDHHKTWDLLRSLHSQVADKWVCGGDFNETMYHFENRGGNAKVDSRISAFREVAAFCEITDLGYSGEPYTWTNNQSGADNIMERLDRVFGNDAWMDFFPGFEVIHLLRKSSDHCPILLTLSKEVENIQPRPKPFRFEAMWLKDGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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