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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001627`

染色体: Chr06 坐标: 18197041-18204258 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001627`
名称	SmilChr06G001627
描述	golgin candidate 2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18197041 - 18204258 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990292`
GeneID	`130990292`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990292`
原始查询	`SmilChr06G001627`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	golgin candidate 2
产物	golgin candidate 2
Arabidopsis	`AT1G18190` (GC2) golgin Putative 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838398] identity=57.6; qcov=0.505; evalue=3.75e-128; confidence=medium
Rice	`Os04g0652500` - identity=51.8; qcov=0.483; evalue=1.09e-102; confidence=medium
GO	GO:0000139 (Golgi membrane); GO:0000301 (retrograde transport, vesicle recycling within Golgi); GO:0007030 (Golgi organization); GO:0031985 (Golgi cisterna)
KEGG	-
Pfam	PF09787 (Golgin_A5)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990292

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057770487.1`
2	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057770487.1`
3	Peroxisome	过氧化物酶体	0.20000	`XP_057770487.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770487.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770487.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18198367`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr6:18198428`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:18198502`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C42
`Chr6:18198659`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	C44,C9
`Chr6:18198659`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	C44,C9
`Chr6:18198713`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr6:18198722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B23,B98,C64,C66
`Chr6:18198824`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B104,B98
`Chr6:18198825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C85
`Chr6:18198880`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C16,C22,C52
`Chr6:18199233`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:18199318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B11,B32,C22,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770487.1

687 aa

344

687

Golgin_A5

PF09787 Golgin_A5 379-665 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770487.1`	Pfam	`PF09787`	Golgin_A5	Coiled-coil	379	665	8.8e-22	78.7	Golgin subfamily A member 5

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914504.1
TCACTCAGGAATTTATTTTAGCAACGGAGTATGTTCGATCAAACAGTGGCAGTTCAATGCCTGTGACACATGTCGCTCACAGCCGACACATTAGGCAGTAATGAAAGAAAACCGTCACCTAACAAGTAAAATTATCAATCGCTCATTCCCTTCCCCCTCCCTCCTCATTCATGCTACGCTGCTGAAATCCTGAAATCCGTACTTTACACACTCCTCGCGCCCCGCTAAAATGCGCCGTAAGTGAACGAAGCTGATCTATG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990292
ATGGCTCACTGGATCTCCTCGAAGCTCAAAGCCGCTGAAACCCTACTCCAACAGATCGACCAGCAAGCTGCGGAGTCACTAAAAAAAAATGAAAAACAAACAATAGATGATCAATTGGCTGTTGAAACTTCATCGAAAGCTCCTGAAAATAGATCACTGATAAAGGACCAGCTGAAGAAGAAAAGCCCACAAAATGTGCTTAGCCAAAGTATTGCTTCCGGTGACAAACGTGATTTAAATACATTTAGTAGAAGTAACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770487.1
MAHWISSKLKAAETLLQQIDQQAAESLKKNEKQTIDDQLAVETSSKAPENRSLIKDQLKKKSPQNVLSQSIASGDKRDLNTFSRSNSDAKQNDEAGMSLNLNSKSNMSPGLTDSDWTELLSVPDKKAVSGAGVTSQGSNRVPVTRTLKKNGKKVGNSGQGLNLSVVDGRTEKVGNNGVSKSSRKSNVGSESNTSADSDEKTSIVGDATPRNSSFQSLSSRGESNQTLTPIFGTTNLGRVEGVNDIVDGEKLSLLKDSDHS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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