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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001630`

染色体: Chr06 坐标: 18244422-18245951 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001630`
名称	SmilChr06G001630
描述	uncharacterized SmilChr06G001630
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18244422 - 18245951 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990598`
GeneID	`130990598`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990598`
原始查询	`SmilChr06G001630`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
产物	TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509]; symbol=AT1G19260; hit=AT1G19260; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT1G19260` (AT1G19260) TTF-type zinc finger protein with HAT dimerization domain-containing protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838509] identity=54.1; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0301400` - identity=39.2; qcov=0.811; evalue=1.69e-89; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF14291 (DUF4371); PF27073 (FAM200-ZBED5_RNase-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990598

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770805.1`
2	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057770805.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770805.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770805.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770805.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18244574`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B1,B119,B22,B30,B34,B48,B7,B79,C15,C25
`Chr6:18244755`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,B4,B46,C8
`Chr6:18244831`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B65
`Chr6:18244831`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B65
`Chr6:18245204`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	frameshift_variant	3	C23,C7,D10
`Chr6:18245204`	`C`	`CAT`	2bp_insertion	CDS_variant	3	C23,C7,D10
`Chr6:18245252`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr6:18245297`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A7,B1,B35
`Chr6:18245453`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:18245459`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:18245584`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B114,B129
`Chr6:18245592`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770805.1

509 aa

254

509

DUF4371

FAM200-ZBED5_RNase-like

PF14291 DUF4371 79-314 aa PF27073 FAM200-ZBED5_RNase-like 201-319 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770805.1`	Pfam	`PF14291`	DUF4371	Domain	79	314	3.1e-111	371.3	ZMYM1/FAM200, RNase-like domain
`XP_057770805.1`	Pfam	`PF27073`	FAM200-ZBED5_RNase-like	Domain	201	319	1.4e-08	35.3	FAM200/ZBED5 RNase-like

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914822.1
ATGAGCTATCCTCCAAACATGATCGAGCAGGTGCGTAGAGCTTACTTATTAAAAGGTCCATGTCAATCGCGTAATCATGATTTTCCACAGAAAATAGAGGCCAATAGAAAGCGAAAATTTGTTTCAGCTTGGTTTGATGAATTCAAGATGTGGTTGGAATATAGTATTGCAAAAGATGATGTTTTTTGCTTATATTGTTATTTGTTTTCATCGGGTAATAGTGAAAAAGGACATGATGCTTTTATATCTGGAGGGTTTAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990598
ATGAGCTATCCTCCAAACATGATCGAGCAGGTGCGTAGAGCTTACTTATTAAAAGGTCCATGTCAATCGCGTAATCATGATTTTCCACAGAAAATAGAGGCCAATAGAAAGCGAAAATTTGTTTCAGCTTGGTTTGATGAATTCAAGATGTGGTTGGAATATAGTATTGCAAAAGATGATGTTTTTTGCTTATATTGTTATTTGTTTTCATCGGGTAATAGTGAAAAAGGACATGATGCTTTTATATCTGGAGGGTTTAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770805.1
MSYPPNMIEQVRRAYLLKGPCQSRNHDFPQKIEANRKRKFVSAWFDEFKMWLEYSIAKDDVFCLYCYLFSSGNSEKGHDAFISGGFSTWRKKDRLRDHVGEVNSDHNKCRLACQDLMNQAQHIEVTLSRVSKQSQTDYRSRLDASIKCLRYLLMQGMAFRGHDESEESLNQGNFMELLKLLASCSKDISNVVLKNAPENLKLTSPDIQKDIINAIAVETTRAIIDDISNDFFAILVDECRDVSVKEQMGIVLRYVNKKGC...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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