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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001631`

染色体: Chr06 坐标: 18246003-18246638 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001631`
名称	SmilChr06G001631
描述	uncharacterized SmilChr06G001631
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18246003 - 18246638 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990599`
GeneID	`130990599`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990599`
原始查询	`SmilChr06G001631`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666]; symbol=AT3G29765; hit=AT3G29765; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G29765` (AT3G29765) ral transcription factor 2-related zinc finger protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822666] identity=54.8; qcov=0.986; evalue=4.1e-71; confidence=high
Rice	`-` -
GO	GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF05699 (Dimer_Tnp_hAT)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990599

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770806.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770806.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770806.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770806.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770806.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18246078`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63
`Chr6:18246084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	C26
`Chr6:18246084`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C26
`Chr6:18246090`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr6:18246205`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B122
`Chr6:18246238`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B98
`Chr6:18246318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr6:18246371`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A9,B134,B98
`Chr6:18246396`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	21	A7,B102,B103,B105,B108,B109,B114,B133,B42,B43,B57,B68,C10,C11,C14,C23,C32,C48,C67,C69,C74
`Chr6:18246403`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B15,C11
`Chr6:18246416`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B103,B125,B26,C15
`Chr6:18246441`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B86,C35,C45

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770806.1

211 aa

106

211

Dimer_Tnp_hAT

PF05699 Dimer_Tnp_hAT 128-186 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770806.1`	Pfam	`PF05699`	Dimer_Tnp_hAT	Domain	128	186	2.2e-08	34.5	hAT family C-terminal dimerisation region

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914823.1
ATGATTGATATGGAAGATGAATATGCACCTCGAGGAAGAGGAAGACGTAGAGTTGAGAAAATGACAAATCTCCACCATTATCGAGTTGAGCTTTTTTATACTGTGATTGACATGCAGGCTTTAGAGTTAAATCAACGTTTTGATGAAGTCAACACAGAATTGATTTTATGCATGTCATGTTTGGATCCTAGAGACTCATTTGCTGGATTTGATATTGAAAAGCTAGTTCGACTTGCAAAGTTTTATCCGTCTGAATTTTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990599
ATGATTGATATGGAAGATGAATATGCACCTCGAGGAAGAGGAAGACGTAGAGTTGAGAAAATGACAAATCTCCACCATTATCGAGTTGAGCTTTTTTATACTGTGATTGACATGCAGGCTTTAGAGTTAAATCAACGTTTTGATGAAGTCAACACAGAATTGATTTTATGCATGTCATGTTTGGATCCTAGAGACTCATTTGCTGGATTTGATATTGAAAAGCTAGTTCGACTTGCAAAGTTTTATCCGTCTGAATTTTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770806.1
MIDMEDEYAPRGRGRRRVEKMTNLHHYRVELFYTVIDMQALELNQRFDEVNTELILCMSCLDPRDSFAGFDIEKLVRLAKFYPSEFSEVALYELESQLENFIVDVRMDEKFLELSGIGDLAEKMVSTRKHDIFPLVYLLVKLSLTLPVATATVERAFSAMKIINSVLRNRMGDNLLNDCLVPYIEKDVFVNVTNEAIMQRFQNMKNRREML

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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