当前解析结果
SmilChr06G001638| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001638 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001638 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001638 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 18469982 - 18471883 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990602 |
|---|---|
| GeneID | 130990602 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990602 |
| 原始查询 | SmilChr06G001638 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990602 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770810.1 |
| 2 | Nucleus | 细胞核 | 0.60000 | XP_057770810.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057770810.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057770810.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770810.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:18470007 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B24,B34 |
Chr6:18470016 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B21,C63 |
Chr6:18470047 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B32,C74 |
Chr6:18470070 |
AAT |
A |
2bp_deletion | frameshift_variant | 2 | A1,B74 |
Chr6:18470070 |
AAT |
A |
2bp_deletion | CDS_variant | 2 | A1,B74 |
Chr6:18470076 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B75,C66 |
Chr6:18470093 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A4,A9,B19,C31,C35 |
Chr6:18470108 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B47,B70,C54,D1 |
Chr6:18470127 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B24,B4,B46,C41 |
Chr6:18470203 |
C |
CAT |
2bp_insertion | frameshift_variant | 31 | A16,B118,B119,B120,B122,B126,B128,B133,B136,B138,B38,B41,B43,B48,B69,B79,B84,B90,B99,C15,C16,C2,C21,C23,C24,C33,C51,C59,C71,C82,C9 |
Chr6:18470204 |
G |
GA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 29 | A16,B118,B119,B120,B122,B126,B128,B133,B136,B138,B38,B41,B43,B48,B69,B79,B84,B99,C15,C16,C2,C21,C24,C33,C51,C59,C71,C82,C9 |
Chr6:18470224 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 31 | A10,A5,B109,B114,B120,B20,B28,B36,B43,B49,B50,B55,B66,B86,B90,B92,B93,C33,C34,C35,C40,C53,C57,C60,C66,C77,C78,C79,C86,D2,D5 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。