当前解析结果
SmilChr06G001639| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001639 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001639 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001639 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 18480260 - 18482161 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990603 |
|---|---|
| GeneID | 130990603 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990603 |
| 原始查询 | SmilChr06G001639 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990603 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 0.80000 | XP_057770811.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.80000 | XP_057770811.1 |
| 3 | Cytoplasmic granule | 细胞质颗粒 | 0.40000 | XP_057770811.1 |
| 4 | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | Cytoplasmic ribonucleoprotein granule | 0.40000 | XP_057770811.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057770811.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:18480285 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B140,B24,B46 |
Chr6:18480294 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B109,B67,C63,C9 |
Chr6:18480312 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr6:18480325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B32,B69,C74 |
Chr6:18480779 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B72,C28,C63 |
Chr6:18480834 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B48,C22,C32,C44,C5 |
Chr6:18480855 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B48,C22,C44,C5 |
Chr6:18480880 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 18 | B122,B123,B128,B18,B37,B59,B6,B87,B88,B89,B9,B91,C3,C50,C54,C67,C69,C84 |
Chr6:18480906 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B135,B96,C77 |
Chr6:18480919 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A2,A23,B105,C23,C9 |
Chr6:18480931 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 39 | A18,A3,B107,B123,B128,B135,B136,B18,B23,B24,B25,B27,B33,B37,B39,B58,B59,B6,B73,B88,B89,B91,C19,C2,C3,C37,C50,C53,C54,C55,C6,C61,C62,C67,C75,C8,C84,D4,D9 |
Chr6:18480963 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B57,B90,B92 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。