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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001652`

染色体: Chr06 坐标: 18716913-18720287 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001652`
名称	SmilChr06G001652
描述	protein DETOXIFICATION 16-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18716913 - 18720287 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990312`
GeneID	`130990312`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990312`
原始查询	`SmilChr06G001652`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein DETOXIFICATION 16-like
产物	protein DETOXIFICATION 16-like
Arabidopsis	`AT5G52450` (AT5G52450) MATE efflux family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835321] identity=64.9; qcov=0.983; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os06g0494400` - identity=62.6; qcov=0.961; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0015297 (antiporter activity); GO:0016020 (membrane); GO:0042910 (xenobiotic transmembrane transporter activity); GO:1990961 (xenobiotic detoxification by transmembrane export across the plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01554 (MatE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990312

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770513.1`
2	Vacuole	液泡	0.60000	`XP_057770513.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.60000	`XP_057770513.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770513.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18717192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C14,C85,D5
`Chr6:18717342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B38
`Chr6:18717342`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B38
`Chr6:18717879`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:18717953`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B62,D5
`Chr6:18718323`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B37
`Chr6:18718323`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B37
`Chr6:18718345`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:18718999`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:18719017`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B27,B30,B57,C35
`Chr6:18719187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D5
`Chr6:18719264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770513.1

484 aa

242

484

MatE

PF01554 MatE 42-202 aa PF01554 MatE 263-424 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770513.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	42	202	2.5e-65	219.8	MatE
`XP_057770513.1`	Pfam	`PF01554`	MatE	Family	263	424	2.5e-65	219.8	MatE

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914530.1
GAGTTGCCATATTGAATATAGTACATTATTTGAGTCAAGAACATTGTGCCCGATAAACATGGTATGACGACTACTTTTAGTGAATCATATTTGAGGCTCATTCCAAATATTCTCCTACATTTACGCACCAAAACTATCTGCAATCAAGTTTTTGATAATCTATGCAAATCTTATATACAGCCATTCTCATCGGAATCTCAATTTCGTAAACAAGGAGAGAGAGAGAGAGATGGACGGACACGAAAACAATACATCCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990312
ATGGACGGACACGAAAACAATACATCCTCTCTCAGCACTCCATTAAATAGTAGTTCAGAAAAGATTAAAGATGAAAATGGTTCGTTTTTGGAGGAACTCAGAAAGCAATTATGGCTGGCGGGGCCTCTGATTTCGGTGTCTCTGCTGCAGTTTTGTTTGCAGCTGATTTCAGTTATGTTTGTGGGCCATTTGGGAGAGCTCGCTCTTTCTGCTGCTTCCATGGCCACCTCCTTCGCCTCTGTCACCGGTTTTAGCTTGCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770513.1
MDGHENNTSSLSTPLNSSSEKIKDENGSFLEELRKQLWLAGPLISVSLLQFCLQLISVMFVGHLGELALSAASMATSFASVTGFSLLMGMASALDTLCGQSYGAKQYHMLGIHTQRAMLVLLLACVPLAVIWANTGPILEALGQDPDISREAGSYARYMIPCVFGYSILQCQVRFLQTQSIVFPMMISTAITTLLHLLVCWILVFKSGLGSKGAAVASCVSYWLNALLLALYIKYSSSCSKTWAGFSREALHNIFDFLRL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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