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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001658`

染色体: Chr06 坐标: 18866405-18868310 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001658`
名称	SmilChr06G001658
描述	T-complex protein 1 subunit delta
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18866405 - 18868310 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990316`
GeneID	`130990316`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990316`
原始查询	`SmilChr06G001658`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	T-complex protein 1 subunit delta
产物	T-complex protein 1 subunit delta
Arabidopsis	`AT3G18190` (AT3G18190) TCP-1/cpn60 chaperonin family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821346] identity=87.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0332200` - identity=80.4; qcov=0.996; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0005832 (chaperonin-containing T-complex); GO:0006457 (protein folding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity); GO:0051082 (GO:0051082); GO:0140662 (ATP-dependent protein folding chaperone)
KEGG	-
Pfam	PF00118 (Cpn60_TCP1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990316

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057770518.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770518.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770518.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770518.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770518.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18866909`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:18866996`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C53,C68
`Chr6:18867323`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,D3
`Chr6:18867365`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B127
`Chr6:18867443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:18867511`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	2	B15,B69
`Chr6:18867511`	`TTG`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	2	B15,B69
`Chr6:18867540`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B125,B70,C4,C63
`Chr6:18867560`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B125,B70,C4,C63
`Chr6:18867563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B125,B70,C4,C63
`Chr6:18867566`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B125,B70,C4,C63
`Chr6:18867569`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A10,B125,B70,C4,C63

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770518.1

532 aa

266

532

Cpn60_TCP1

PF00118 Cpn60_TCP1 35-530 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770518.1`	Pfam	`PF00118`	Cpn60_TCP1	Family	35	530	5.5e-158	527.4	TCP-1/cpn60 chaperonin family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914535.1
TTTGCATATATCGTACGCCTCACTCCAACTTTCACTAGAAAACCCTTTTCCGCTCTCATACTCTCCATCGCGCTTTCTCTCTCTAGGGTTTTACGTCTCAAATCTCGCTCTCTCTCAACCCTCCTAAACAATGGCGTCCGCGGCGGTGGCAAAGGCGAAGCCGACAGAGACGTTCGTCGACAACAAGCGGAAAGACGACATCCGGATGGCGAACATCGCGGCGGCGCAGGCGGTGGCGGACGCCGTCCGGACCAGCCTCG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990316
ATGGCGTCCGCGGCGGTGGCAAAGGCGAAGCCGACAGAGACGTTCGTCGACAACAAGCGGAAAGACGACATCCGGATGGCGAACATCGCGGCGGCGCAGGCGGTGGCGGACGCCGTCCGGACCAGCCTCGGCCCCAAGGGTATGGACAAGATGATCTCCACCGCTTCCGGCGAGGTCATTATCACCAACGACGGCGCCACGATCCTCAACAAGATGGAGGTCCTCCAGCCCGCCGCCAAGTTCCTCGTCGAGCTCTCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770518.1
MASAAVAKAKPTETFVDNKRKDDIRMANIAAAQAVADAVRTSLGPKGMDKMISTASGEVIITNDGATILNKMEVLQPAAKFLVELSKSQDVVAGDGTTTVVVIAGALLKASLTLLNAGIHPTVVSDSLHKASIKAVEILSAMAVPVELSDRDSLVKSASTSLNSKVVSQYSTLLAPLAVDAVLSVVDPEKPDLVDLKDIKIVKKLGGTVDDTELVKGLVFDKKVSHAAGGPTRVENAKIAVIQFQISPPKTDIEQSIVVS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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