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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001659`

染色体: Chr06 坐标: 18868520-18871120 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001659`
名称	SmilChr06G001659
描述	WAT1-related protein At3g18200-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	18868520 - 18871120 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990317`
GeneID	`130990317`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990317`
原始查询	`SmilChr06G001659`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WAT1-related protein At3g18200-like
产物	WAT1-related protein At3g18200-like
Arabidopsis	`AT3G18200` (UMAMIT4) nodulin MtN21 /EamA-like transporter family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821347] identity=65.6; qcov=1; evalue=1.56e-169; confidence=high
Rice	`Os01g0117900` (OsUMAMIT1) - identity=57.5; qcov=1; evalue=8.59e-149; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0022857 (transmembrane transporter activity)
KEGG	-
Pfam	PF00892 (EamA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990317

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770519.1`
2	Vacuole	液泡	0.40000	`XP_057770519.1`
3	Vacuole membrane	液泡膜	0.20000	`XP_057770519.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770519.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770519.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:18869001`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:18869085`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14
`Chr6:18870156`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B100,B60,C27
`Chr6:18870215`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B21
`Chr6:18870215`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B21
`Chr6:18870236`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B47,C46,D5
`Chr6:18870641`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:18870641`	`TGA`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B118,B67,C63
`Chr6:18870800`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:18870899`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770519.1

357 aa

178

357

EamA

PF00892 EamA 14-152 aa PF00892 EamA 180-318 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770519.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	14	152	3e-25	89.8	EamA-like transporter family
`XP_057770519.1`	Pfam	`PF00892`	EamA	Domain	180	318	3e-25	89.8	EamA-like transporter family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914536.1
GAGCTTCAATGATTACTCTCCAATTTGCATATGCTTCAAGGCAGCTAACCCACCATCTTTTCTCTATCAAATAATACATCTCACACTATAAAAAATTATGTCCCTGGATATCTCTGTCTATATATATGCAACAGAAACAAAGACAACATACAACACACACAAAAACGACGAGATATGGCACAGGAAAGCATCGTTTCTGAGAGGGCGAAGCTCGTGATATCGTTGATCATTCTGCAGCTATGCTTTGCAGGGTTTCACAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990317
ATGGCACAGGAAAGCATCGTTTCTGAGAGGGCGAAGCTCGTGATATCGTTGATCATTCTGCAGCTATGCTTTGCAGGGTTTCACATAGTCTCAAGAGTTGCCCTCAACATTGGTGTTAGCAAGATTGTCTACCCTATTTACAGAAACATTATTGCATTGCTATTGGTAGGGCCTTTTGCCTACTTCATGGAAAAGAAGGAAAGAACACCTCTCACATTCTCATTGTTGGCTGAGTTCTTCCTTCTTGCACTAGTGGGAAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770519.1
MAQESIVSERAKLVISLIILQLCFAGFHIVSRVALNIGVSKIVYPIYRNIIALLLVGPFAYFMEKKERTPLTFSLLAEFFLLALVGITANQVYYILGLYYASPTFVSAMQNTVPALTFIMATALRIEQVNVMRMDGLVKVLGTLVSIGGATVITLYKGPPILNGTNSSTESSSKMQSWAWGCIFTFCHCLSWAGWMVLQAPIVKKYPAKLSLTSFTLFFGLIQFLCIAAFTERDPTHWQIVSGEEIFTILYAGIISSGLV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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