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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001678`

染色体: Chr06 坐标: 19055294-19060520 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001678`
名称	SmilChr06G001678
描述	aspartyl protease APCB1
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19055294 - 19060520 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990337`
GeneID	`130990337`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990337`
原始查询	`SmilChr06G001678`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	aspartyl protease APCB1
产物	aspartyl protease APCB1
Arabidopsis	`AT1G49050` (AT1G49050) Eukaryotic aspartyl protease family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841328] identity=49; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0730700` - identity=46.9; qcov=0.977; evalue=2.39e-174; confidence=high
GO	GO:0004190 (aspartic-type endopeptidase activity); GO:0006508 (proteolysis)
KEGG	-
Pfam	PF00026 (Asp); PF14541 (TAXi_C); PF14543 (TAXi_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990337

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057770538.1`
2	Vacuole	液泡	0.20000	`XP_057770538.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770538.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770538.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770538.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19055773`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A21,A23,B137,B139,B69,B91,C37,C4,C87
`Chr6:19055918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B107
`Chr6:19058467`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B34,C85
`Chr6:19058542`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B71
`Chr6:19058908`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr6:19059019`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:19059144`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A2,C42
`Chr6:19059843`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:19059888`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B103,B73,B99,C44,C75
`Chr6:19060164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	23	A16,A5,A6,B124,B125,B2,B27,B30,B60,B71,C16,C17,C2,C23,C38,C4,C43,C47,C54,C60,C62,C63,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770538.1

574 aa

287

574

TAXi_N

Asp

TAXi_C

PF14543 TAXi_N 200-375 aa PF00026 Asp 200-555 aa PF14541 TAXi_C 417-556 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770538.1`	Pfam	`PF14543`	TAXi_N	Domain	200	375	5.1e-48	164.3	Xylanase inhibitor N-terminal
`XP_057770538.1`	Pfam	`PF00026`	Asp	Domain	200	555	2.9e-20	73.7	Eukaryotic aspartyl protease
`XP_057770538.1`	Pfam	`PF14541`	TAXi_C	Domain	417	556	8.7e-13	49.1	Xylanase inhibitor C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914555.1
ATTTTACGACTGTCGTGTAAATTGACTTTGAAAATAGTGGCAGCTATTAGTCTTCCCTCCTCCATCTTCAACCTTCATCCTTCCCTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTAACTGAAGAGAGAGACAGACTGGCGATGGCGGACGACACTAATGAGCCCTCCCCTCAGCTCACAGGCATAGTCATAATCACTCTGCCCCCGCCCGACAACCCTTCTTTGGGTAAAACCATCACTGCCTACACTCTCTCCGATAATCAAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990337
ATGGCGGACGACACTAATGAGCCCTCCCCTCAGCTCACAGGCATAGTCATAATCACTCTGCCCCCGCCCGACAACCCTTCTTTGGGTAAAACCATCACTGCCTACACTCTCTCCGATAATCAAATTTCCTCAACTTCACAATCACTTCATCCACCAAACGATCCGTCTCCGTCCCCGCCGCCTCAGAGTAGTCGTCAATCTCTGTCTTCGTTGAGGAGTTTCAGCCACCGCAGCCCAAGGACTATTCTGCCGATTCTAGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770538.1
MADDTNEPSPQLTGIVIITLPPPDNPSLGKTITAYTLSDNQISSTSQSLHPPNDPSPSPPPQSSRQSLSSLRSFSHRSPRTILPILGIALIALYVWSSVSQEEFFRLRDHVENYDDDDDDDNQKNKSRSTFILPLYRKPYGGNGDLPDVELKLGRIRALKEVDSAMRARKISKKSVSAASKIDSASVIPVGGNIYLEGMYYTYLHFGNPPRPYFLDIDTGSDLTWIQCDAPCTSCAKGAHPFYKPVKDKIILPKDSYCLE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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