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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001683`

染色体: Chr06 坐标: 19083210-19085907 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001683`
名称	SmilChr06G001683
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19083210 - 19085907 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990341`
GeneID	`130990341`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990341`
原始查询	`SmilChr06G001683`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	organelle RRM domain-containing protein 2, mitochondrial-like
产物	organelle RRM domain-containing protein 2%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT2G37510` (AT2G37510) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818327] identity=54.6; qcov=0.864; evalue=4.16e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0278800` - identity=69.5; qcov=0.67; evalue=1.81e-53; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990341

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770545.1`
2	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057770545.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770545.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770545.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770545.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19083585`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B130,B17,B30,B73,C29
`Chr6:19083598`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	38	A13,A23,A24,A9,B1,B103,B112,B119,B122,B123,B134,B18,B27,B34,B45,B48,B49,B53,B55,B73,B87,B97,C2,C31,C32,C33,C42,C44,C45,C58,C60,C65,C68,C75,C78,C79,C85,D7
`Chr6:19083628`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B104,B9
`Chr6:19083628`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B104,B9
`Chr6:19083859`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10
`Chr6:19083870`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B24
`Chr6:19083872`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B5,C23,C52,C59
`Chr6:19083881`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A25,B88,C1,C50
`Chr6:19083889`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,A3
`Chr6:19083892`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A7,C86
`Chr6:19083893`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C38
`Chr6:19083905`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	55	A13,A15,A24,B101,B104,B105,B112,B114,B12,B122,B127,B129,B136,B137,B16,B18,B19,B20,B28,B41,B48,B53,B66,B78,B82,B95,C10,C14,C15,C17,C18,C2,C21,C33,C34,C41,C42,C47,C54,C58,C6,C63,C65,C68,C69,C7,C72,C73,C74,C78,C79,C81,C83,C85,D9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770545.1

176 aa

176

RRM_1

PF00076 RRM_1 68-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770545.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	68	134	1e-18	67.6	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914562.1
ACACACACAACCGGAAGTCTCTCTCTCTATTCTCGCGACACACACAGACACACACAACAGACGCCGCCGGCCTCTCCTCTGGGGAAGGCAGCCTTCGGCCTCACCTCCCTCGACTCCGCGACTGCTGCCTCTCTCTCAGTTTTCACCGAGAATCCGCCTCTTCTCCCTCAGAAATCCGCCGCCGCGGAAGCTCGCCGGAGAGACGACGATAAGCCGCCTCAACCGTCGGCTCTCTCTCTTTCGATCTCGACTCCCAGCGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990341
ATGCGAATCGATTTTCTACTTTCGAATCGATGGATTCTGAACCCTCTAGATCAGATTGAGCTGGAAATTCAAAACCTTATGGCCTTCGCTTCAGCTTTCCATCGCATTTTTAACGGATCATCCACGCCGTCGCTCAATATACACTCGCAGTTCTGTTCGATTCGCTTCAGTTCCACGCTTCCGACGCTCACCTCTCCTAAGCTCTTCATCAGCGGTCTTTCAAGAACGACAAGTGATGATAACCTATACAAGGCATTTGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770545.1
MRIDFLLSNRWILNPLDQIELEIQNLMAFASAFHRIFNGSSTPSLNIHSQFCSIRFSSTLPTLTSPKLFISGLSRTTSDDNLYKAFAPFGNLREAKIIIDRGSGKSRGFGFVTYDTVEEAEKAREGMNAKFLDGWVIFVDPAKPREAPQQPPPPRRDMQSTETGYTTNRTVGWSGY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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