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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001696`

染色体: Chr06 坐标: 19383692-19390221 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001696`
名称	SmilChr06G001696
描述	transcription factor DICHOTOMA-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19383692 - 19390221 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990350`
GeneID	`130990350`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990350`
原始查询	`SmilChr06G001696`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor DICHOTOMA-like
产物	transcription factor DICHOTOMA-like
Arabidopsis	`AT3G18550` (BRC1) TCP family transcription factor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821386] identity=37.2; qcov=0.696; evalue=5.6e-25; confidence=medium
Rice	`Os03g0706500` (FC1) - identity=45.5; qcov=0.545; evalue=3.1e-27; confidence=medium
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding); GO:2000032 (regulation of secondary shoot formation)
KEGG	-
Pfam	PF03634 (TCP)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990350

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770552.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770552.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770552.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770552.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770552.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19389195`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B120,B123,B17,B87,C51
`Chr6:19389195`	`ACT`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B120,B123,B17,B87,C51
`Chr6:19389208`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:19389786`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A14,B57
`Chr6:19389819`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770552.1

286 aa

143

286

TCP

PF03634 TCP 81-204 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770552.1`	Pfam	`PF03634`	TCP	Family	81	204	2.3e-35	123.2	TCP family transcription factor

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914569.1
TCAAAATTTGAAGTCCCATAGAAAGGGTTATACACTATTACAAGTATTAAAGAATGGGGAATACTACAAAAGAGACGCTTATTCGAACAGTAGAAAAGAGTGAGAGAGGAAATTAACTCGAGCATATAGTTGCCGTAAGCAGCTGTCTTTCTCAACCAAAAGTTTGATCACATCAACTTCTTCCATGATATGAGTGGTGATGAACCACACAAGTCAATTATATGGAGCATAAATATCAACCAACCTAAGTTGCATCAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990350
ATGCTTTCATCCAACAGCAGCAGTTGTAATCACAACCCTAATTACACACCCTTTTCCGAAAATGACATCACCTCCTTCACCTCTTCCAAATCCCCAGACTACCCTAATTTCCTGGTGGGGTTGGAAGATTACCAAGACCTCTATCTTCATCACTTCCTCGATCACGTCTACCTAAACACGCTTCCTCAGCACGACATCCCCGCGGCCGCAGTTGCCGTCCCAGCCACGGCGGCGGCCGCCCCGAAGAAGGACCGCCACAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770552.1
MLSSNSSSCNHNPNYTPFSENDITSFTSSKSPDYPNFLVGLEDYQDLYLHHFLDHVYLNTLPQHDIPAAAVAVPATAAAAPKKDRHSKINTARGPRDRRMRLSLDIARKFFDLQDLLGFDKASRTVDWLLRSSRPAIRALERGRAGLQSDSCTSEECGEAVSAASRRGKRVRRGGARQKRATVVARESRRKARERARERTSQKRRLMRERESESGGGVPILYGDVKVVEEFSADEAWICGAADQPWNSFHLHQTQHAAFF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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