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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001699`

染色体: Chr06 坐标: 19495009-19501255 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001699`
名称	SmilChr06G001699
描述	uncharacterized SmilChr06G001699
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19495009 - 19501255 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990352`
GeneID	`130990352`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990352`
原始查询	`SmilChr06G001699`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os12g0544600; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os12g0544600; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os12g0544600` - identity=41.5; qcov=1.04; evalue=1.05e-77; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF13952 (DUF4216); PF13960 (DUF4218)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990352

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770554.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770554.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770554.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770554.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770554.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19495630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C74
`Chr6:19495693`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C36
`Chr6:19495721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	17	B103,B15,B40,B65,B69,B73,B75,B91,B99,C30,C44,C46,C48,C49,C75,D11,D3
`Chr6:19495757`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	47	A11,A19,A22,A7,B109,B110,B112,B115,B118,B121,B139,B20,B33,B34,B35,B42,B43,B49,B55,B60,B67,B76,B79,B82,B86,B93,B99,C14,C16,C22,C34,C48,C50,C51,C52,C60,C63,C78,C81,C82,C85,C86,D2,D4,D5,D6,D7
`Chr6:19495775`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C41
`Chr6:19495783`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:19497722`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:19497726`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B61,C47
`Chr6:19498003`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B104,B61,C47
`Chr6:19498013`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A24,A4,B105,C33
`Chr6:19498038`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A15,B80,C38,D10
`Chr6:19498048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B72,B98

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770554.1

293 aa

146

293

DUF4218

DUF4216

PF13960 DUF4218 1-77 aa PF13952 DUF4216 248-288 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770554.1`	Pfam	`PF13960`	DUF4218	Domain	1	77	7.4e-36	123.2	Domain of unknown function (DUF4218)
`XP_057770554.1`	Pfam	`PF13952`	DUF4216	Domain	248	288	3.9e-09	37.7	Domain of unknown function (DUF4216)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914571.1
TATGGGTTAAACAAAACATTACCTTCAATTTGCCCCAAACCACAATGCCTCCATCTTTCTGCCTTCTCCTCCGGACCACCCAGCTCAGTGTCGTGCCATCTCCGTTTCGTCGTCGTCCTCCGGCCATCCAGTACAACATCGCACAATCTCATCCATCTGCGGACCAACCAGCACAGCTGCGCACAATCGCTGCCATCTGTGCCGCCTCCTCCTCTGGACCACCCAGAACAGCGTCACACCATCTCGGCCTTCGCCCGAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990352
ATGGAGCATTTGCCTATTCACTTGCCGGAAGAGGCTAAACTTGCTGGACCTGTTCAGTTTCGCTCTATGTACCCCATTGAGAGGTATTTGTGCACATTGAAAAACTATGTCCGCACTCGAAGTCACCCTGAAGGATCTATAGCTGAGGGGTATCTCGCTGAAGAATGCATGACATTTTGTTCGATGTATTTAACTGATGTCGAGTCAAAGTTGAATAGACCAAATAGAAACAATGAAAATGGTGGGATTGGTCCAATCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770554.1
MEHLPIHLPEEAKLAGPVQFRSMYPIERYLCTLKNYVRTRSHPEGSIAEGYLAEECMTFCSMYLTDVESKLNRPNRNNENGGIGPIQDGRPLGKEEIFMLDDIEWIQAHRCVLNSLSIVDNFKREHLRVLQRNRKNGRMSNYDRQKLHTETFHHWFKSQVNEMANTSSESLHPDIPFLAVGPSKWARRYTGYIVNVLRFHTKKREMRRKTQNSGVFLAATTNSFSSSKDKNPISGDVSFYGVLKDIVEVKYTNNLKFVLF...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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