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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001703`

染色体: Chr06 坐标: 19581398-19583833 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001703`
名称	SmilChr06G001703
描述	uncharacterized SmilChr06G001703
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19581398 - 19583833 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990354`
GeneID	`130990354`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990354`
原始查询	`SmilChr06G001703`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
产物	hit=Os03g0643050; species=rice; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G41980` (AT5G41980) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834203] identity=35.5; qcov=1.05; evalue=1.73e-34; confidence=medium
Rice	`Os03g0643050` - identity=42; qcov=1.03; evalue=1.1e-53; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF01609 (DDE_Tnp_1); PF13359 (DDE_Tnp_4)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990354

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770556.1`
2	Chromosome	染色体	0.40000	`XP_057770556.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057770556.1`
4	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057770556.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770556.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19583045`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	A21,D4
`Chr6:19583045`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	2	A21,D4
`Chr6:19583057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	8	A19,B110,B121,B42,B43,B60,C50,D6
`Chr6:19583058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B77,C18,C63
`Chr6:19583064`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,B26,B72,B98,C42
`Chr6:19583094`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:19583096`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A21,D4
`Chr6:19583147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19583148`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21
`Chr6:19583150`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19583171`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19583318`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A2,A21,B26,C42,D4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770556.1

218 aa

109

218

DDE_Tnp_4

DDE_Tnp_1

PF13359 DDE_Tnp_4 5-148 aa PF01609 DDE_Tnp_1 7-153 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770556.1`	Pfam	`PF13359`	DDE_Tnp_4	Domain	5	148	9.4e-20	71.5	DDE superfamily endonuclease
`XP_057770556.1`	Pfam	`PF01609`	DDE_Tnp_1	Domain	7	153	2.6e-05	24.8	Transposase DDE domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914573.1
AAGGATTGCTACAGCCTACAGTGCTCAAGGTTATTTCTTTCGATACCATTTTTGCCCTTATTATTCAAATTCAAATGCTTCAAAATTCTCATTTCATCTGCGTCTGTATCCCTGTCAATTCTCCTCGTCGGCTACTGAGGAACATCCAATCGACGTTCGCGTGCATACACCAGATCTGGGGAAGTATCGCATTCGGGAAAGATCTTGTTCGTCCCTCATTTCAGCTGTGGGTTACTCATTGGTGGATTCACTTTCTTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990354
ATGATGCCCAATAAAGATAAACCAAGGTATAGGACACGAAAAAGCCATATATCCACTAATACCCTTGCCATGTGCGATCGATATTTGAAGTTTGTTTATGTCTTGCCTGGGTGGGAGGGCTCGGCAGCTGATTCTAGGGTTCTACGAGATGCACTCACTAGACCACATGGATTGAGGGTGCCAAAGGGAAATTATTACTTGTGTGATAACAGCTACGCGAACTGTGATGGTTTCTTGGCGCCGTATAAGAGTGTACGATA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770556.1
MMPNKDKPRYRTRKSHISTNTLAMCDRYLKFVYVLPGWEGSAADSRVLRDALTRPHGLRVPKGNYYLCDNSYANCDGFLAPYKSVRYHLKEWGPMCARPQNTQELFNLRHAKARNIIERAFGIMKMRWGILQSTSYYPVKTQNRLIMAWFIINNFIRSEMAVDPIEQEFDNLFQDNAVLETEHEEYIEGVESSPEWNAARDALATAKWHQYIANFDHM

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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