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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001713`

染色体: Chr06 坐标: 19722674-19724315 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001713`
名称	SmilChr06G001713
描述	uncharacterized SmilChr06G001713
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19722674 - 19724315 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990622`
GeneID	`130990622`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990622`
原始查询	`SmilChr06G001713`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os08g0177800; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os08g0177800; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`AT3G01410` (AT3G01410) Polynucleotidyl transferase, ribonuclease H-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821319] identity=29.7; qcov=0.229; evalue=1e-06; confidence=weak
Rice	`Os08g0177800` - identity=32.6; qcov=0.178; evalue=2.29e-07; confidence=weak
GO	GO:0003676 (nucleic acid binding); GO:0004523 (RNA-DNA hybrid ribonuclease activity)
KEGG	-
Pfam	PF13456 (RVT_3); PF17921 (Integrase_H2C2); PF31073 (DUF8803)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990622

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770824.1`
2	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057770824.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770824.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770824.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770824.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19722691`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr6:19722716`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19722722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A23,C84
`Chr6:19722724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B133,B40,B91,C87
`Chr6:19722724`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B133,B40,B91,C87
`Chr6:19722737`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B26,C42
`Chr6:19722738`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:19722740`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr6:19722740`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr6:19722742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,B26,C42,D4
`Chr6:19722777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B75,B9,C44
`Chr6:19722777`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B75,B9,C44

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770824.1

484 aa

242

484

RVT_3

Integrase_H2C2

DUF8803

PF13456 RVT_3 5-116 aa PF17921 Integrase_H2C2 201-256 aa PF31073 DUF8803 428-463 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770824.1`	Pfam	`PF13456`	RVT_3	Domain	5	116	1.3e-18	67.8	Reverse transcriptase-like
`XP_057770824.1`	Pfam	`PF17921`	Integrase_H2C2	Domain	201	256	1.5e-10	41.8	Integrase zinc binding domain
`XP_057770824.1`	Pfam	`PF31073`	DUF8803	Domain	428	463	6.3e-09	36.3	Domain of unknown function (DUF8803)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914841.1
ATGACTAAAGAGAGTTGTGGGATAGGCATTTACATTCGTACTCCTCTGGATGATGAGCTCCAATTCGCTATTAAATATGAACAAAGGTTATCCAATAACGAGGCCGAATATGAGGCTGTGGTTAAGGCCTTACAATTTTTGGCAGAGCTAGGAGCTGAGCAAGTGCGAATGAAATCCGATTCTCAACTCGTAGTACAACAACTGCTGGGAGAATACGATGTGCGAGAGGATAGGATGATAGCTTATTATACTCGGGCTCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990622
ATGACTAAAGAGAGTTGTGGGATAGGCATTTACATTCGTACTCCTCTGGATGATGAGCTCCAATTCGCTATTAAATATGAACAAAGGTTATCCAATAACGAGGCCGAATATGAGGCTGTGGTTAAGGCCTTACAATTTTTGGCAGAGCTAGGAGCTGAGCAAGTGCGAATGAAATCCGATTCTCAACTCGTAGTACAACAACTGCTGGGAGAATACGATGTGCGAGAGGATAGGATGATAGCTTATTATACTCGGGCTCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770824.1
MTKESCGIGIYIRTPLDDELQFAIKYEQRLSNNEAEYEAVVKALQFLAELGAEQVRMKSDSQLVVQQLLGEYDVREDRMIAYYTRAQELMAKFQECHIEQISWEQNNRADLLARMASTVEQSWTNKVTLLCEPYYEESQQILTLEERDDWRSPIVHFLKMRERLNPIVSQRCLYHRYCLINDQLYKRSFTHPLLKILSPEEAQYALDEIHQGYCGNHVGYKDLLRKIIKVGFYWPQMGEDAKKIVKKCIVCQKHAPKINV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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