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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001726`

染色体: Chr06 坐标: 19896716-19899644 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001726`
名称	SmilChr06G001726
描述	mitochondrial outer membrane protein porin of 34 kDa-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19896716 - 19899644 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990377`
GeneID	`130990377`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990377`
原始查询	`SmilChr06G001726`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	mitochondrial outer membrane protein porin of 34 kDa-like
产物	mitochondrial outer membrane protein porin of 34 kDa-like
Arabidopsis	`AT3G01280` (VDAC1) voltage dependent anion channel 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820914] identity=67.2; qcov=1; evalue=3.06e-117; confidence=high
Rice	`Os09g0361400` (OSVDAC1) - identity=64.3; qcov=0.988; evalue=2.69e-112; confidence=high
GO	GO:0005741 (mitochondrial outer membrane); GO:0008308 (voltage-gated monoatomic anion channel activity); GO:0098656 (monoatomic anion transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF01459 (Porin_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990377

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057770582.1`
2	Mitochondrion outer membrane	线粒体外膜	1.00000	`XP_057770582.1`
3	Mitochondrion membrane	线粒体膜	0.80000	`XP_057770582.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057770582.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770582.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19896975`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B113,B50,B65,C49
`Chr6:19898430`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C85
`Chr6:19898703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:19898867`	`G`	`GTA`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B104,B23,B37,B58,C5,C80
`Chr6:19899020`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B24,B69,C30
`Chr6:19899175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A16,C26,C74
`Chr6:19899240`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:19899246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:19899330`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	C52
`Chr6:19899330`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	1	C52
`Chr6:19899362`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B1,B120

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770582.1

244 aa

122

244

Porin_3

PF01459 Porin_3 4-244 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770582.1`	Pfam	`PF01459`	Porin_3	Family	4	244	2.5e-73	247.5	Eukaryotic porin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914599.1
AAAAAAAAAACAGTGCATTTACTTAAAATGTGTTGCATTGTTTCCATATTTTGAAATAAAATCACTAACAAGAGATCAAAATAATTCCATTTGATCTTTGTTTCAATATAATTGATAGTTTTGACCATATGAGCGAAGAAAGTTAAAAATTTATAATTCTCTTAATTTCATTTCGATTCCTCTGTGAATTTCATTTTATGTGCTTTTGTTCGAGTGCTTGATTTCTCGAATTCAAGTGAATAAAATCATGGGCAAAGGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990377
ATGGGCAAAGGTCCAGGCCTATACTCTGATATCGGCAAAAGCGCTCGAGATCTTCTTTACAAGGATTACAACAGCGACCAGAAGTTTACAATCACCACCTACTCTCCTACTGGAGTTACTCTCACTTCTACGGGAACAAAGAAAGGTGAGCTATTATTGGCTGATGTGAACACACAGTTGAAGAACAAAAACATCACCACTGACATCAAAGTCGACACTGGCTCAAATCTCTTCACCACTGTAACAATTGATGAGCTTAC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770582.1
MGKGPGLYSDIGKSARDLLYKDYNSDQKFTITTYSPTGVTLTSTGTKKGELLLADVNTQLKNKNITTDIKVDTGSNLFTTVTIDELTLGLKAILSFRVHDQRSGKLELQYLHEYAGLSSSVGLTANPIVNLSVVLGNNKLALGSDASFDTKEGAFTKCNFGASFTNTDLIAALSLNDKGDTLSASYYHIVSPLSSSVVGAEVTHSFSRNENTITVGTQHQLDPLTTVKARLNNVGKANALIQHE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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