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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001733`

染色体: Chr06 坐标: 19974489-19975753 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001733`
名称	SmilChr06G001733
描述	thioredoxin H2
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	19974489 - 19975753 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990384`
GeneID	`130990384`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990384`
原始查询	`SmilChr06G001733`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H2
产物	thioredoxin H2
Arabidopsis	`AT5G39950` (TRX2) thioredoxin 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:833992] identity=60; qcov=0.985; evalue=1.94e-55; confidence=high
Rice	`Os03g0800700` (OsTRXh4) - identity=54.2; qcov=0.956; evalue=5.99e-44; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF13098 (Thioredoxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990384

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057770605.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057770605.1`
3	Lipid droplet	脂滴	0.20000	`XP_057770605.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057770605.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770605.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:19974590`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	33	A13,A14,A2,A4,A6,A8,A9,B100,B111,B120,B131,B27,B3,B30,B47,B57,B64,B66,B70,B98,C13,C14,C35,C42,C47,C5,C59,C60,C62,C7,C71,D1,D11
`Chr6:19974609`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B112,C46
`Chr6:19974609`	`G`	`GAC`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B112,C46
`Chr6:19974610`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B30,C79
`Chr6:19974610`	`G`	`GC`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B30,C79
`Chr6:19974616`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B112,B30,C46,C79
`Chr6:19974622`	`G`	`GC`	1bp_insertion	frameshift_variant	19	A20,B1,B104,B112,B119,B22,B30,B32,B34,B4,B7,C15,C21,C25,C36,C46,C53,C79,C87
`Chr6:19974711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C18,C85
`Chr6:19974934`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	50	A18,A6,A7,A8,A9,B10,B101,B105,B110,B111,B115,B121,B125,B127,B13,B132,B2,B32,B37,B40,B52,B66,B82,B86,B90,B91,B92,B93,C10,C12,C21,C25,C28,C34,C35,C40,C44,C47,C53,C6,C72,C73,C75,C78,C80,C83,C85,D10,D5,D7
`Chr6:19975012`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	208	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B21,B24,B26,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B57,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C25,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr6:19975016`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	208	A1,A10,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A25,A3,A4,A6,A7,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B128,B129,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B15,B16,B17,B19,B2,B21,B24,B26,B29,B3,B30,B32,B33,B35,B36,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B45,B46,B47,B49,B50,B51,B52,B57,B6,B60,B61,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B74,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C18,C19,C20,C21,C25,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C51,C54,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C63,C64,C65,C66,C67,C68,C69,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C79,C80,C81,C82,C83,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D9
`Chr6:19975018`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770605.1

137 aa

137

Thioredoxin_2

Thioredoxin

PF13098 Thioredoxin_2 39-121 aa PF00085 Thioredoxin 43-126 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770605.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	39	121	2.9e-09	38.0	Thioredoxin-like domain
`XP_057770605.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	43	126	6.2e-28	97.5	Thioredoxin

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914622.1
TAGTATTTTTGGGGGGTTTAATTCAGTTTCAGTATTGACGACGCTCTGCACCTTTGCTTGAGTACTGCCAAAGCATTGAAACATGGGTTCCACTATATCTAGCCTTTTTGGCGCAGGTGTGGGTGAAGAACCAGAACCTTCCGCCGACTCGCGCGTCACCGCCTTTCACTCATCGGACCGCTGGCAGCTCCACTTCGATGCCTCCAAGAAATTAAATAAACTGATGGTGGTGGATTTCACTGCGACATGGTGCGGACCGT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990384
ATGGGTTCCACTATATCTAGCCTTTTTGGCGCAGGTGTGGGTGAAGAACCAGAACCTTCCGCCGACTCGCGCGTCACCGCCTTTCACTCATCGGACCGCTGGCAGCTCCACTTCGATGCCTCCAAGAAATTAAATAAACTGATGGTGGTGGATTTCACTGCGACATGGTGCGGACCGTGCAAGTTCATGGCGCCAGCCTTCGATGCGATGTCCGCCAAATACACCGACGTCGACTTCGTGAAAGTTGATGTCGATGAACT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770605.1
MGSTISSLFGAGVGEEPEPSADSRVTAFHSSDRWQLHFDASKKLNKLMVVDFTATWCGPCKFMAPAFDAMSAKYTDVDFVKVDVDELADVAREFAVQAMPSFVLLKQGKEVDRVVGAKKDELEKKICKHREVPKFAA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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