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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001740`

染色体: Chr06 坐标: 20064716-20066005 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001740`
名称	SmilChr06G001740
描述	LOB domain-containing protein 6-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20064716 - 20066005 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987389`
GeneID	`130987389`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987389`
原始查询	`SmilChr06G001740`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	LOB domain-containing protein 6-like
产物	LOB domain-containing protein 6-like
Arabidopsis	`AT3G47870` (LBD27) LOB domain-containing protein 27 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:823943] identity=53.9; qcov=0.446; evalue=4.94e-39; confidence=low
Rice	`Os08g0402100` - identity=58.9; qcov=0.415; evalue=1.08e-34; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03195 (LOB)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987389

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766885.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766885.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766885.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766885.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057766885.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20064927`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B44,B91,C51,C74
`Chr6:20064970`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr6:20065048`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C50,C57
`Chr6:20065257`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B93,C17
`Chr6:20065268`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B16
`Chr6:20065296`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B24,C17,C30,C74
`Chr6:20065694`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A14

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766885.1

258 aa

129

258

LOB

PF03195 LOB 10-107 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766885.1`	Pfam	`PF03195`	LOB	Family	10	107	1.2e-37	129.2	Lateral organ boundaries (LOB) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910902.1
GAGGACTCAAGAGTCAGAAGCATGAAACAGAATTTCAAAACCAAACTCCCAAATCTTTCGGAAATCCAAAACAATTTCTACCAAGTCCCCATCAACACGTGGCCCTCATCAAAATCCTCCGCCTATATAATCGGCTCCTCCATTTTCGACGGCGGAGCCTACTCCTCAGCATGACTGTCAAGGGCGGAAGCACCCCTGCCTGCGCCGCCTGCAAGTACCAGCGCCGCAAATGCAGCCCCACGTGCCCCCTCGCCCCCTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987389
ATGACTGTCAAGGGCGGAAGCACCCCTGCCTGCGCCGCCTGCAAGTACCAGCGCCGCAAATGCAGCCCCACGTGCCCCCTCGCCCCCTATTTCCCAGCCAATCAGCCCAAGATGTTCCAGAACGTGCACCGCCTCTTCGGCGTCTCCAACGTCACCAAAACCCTAGATGCGCTCAAGACCAAGGAGCAGCGAGAGGACGCCATGCGCTCCATCATCTACGAGGCAGACATGCGCGAGCGCTTCCCCGTCGACGGCTGCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766885.1
MTVKGGSTPACAACKYQRRKCSPTCPLAPYFPANQPKMFQNVHRLFGVSNVTKTLDALKTKEQREDAMRSIIYEADMRERFPVDGCSGVIAQLTHQLRLARDELDYVRATIAACREQAALAAAKPADCWLDYAPGEAAAAGFLFNDGACEPCGSDTMSSNLSSIQAQMEAFVIHQKRNVSVDFGAQQFNNAAAVFDDDRQSSYIEPKNEAFESSLDSTLDDAEESGCRREMRGGAATEHGCRRELRSAAAGFSLTTVN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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