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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001751`

染色体: Chr06 坐标: 20373069-20379243 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001751`
名称	SmilChr06G001751
描述	plant cysteine oxidase 3
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20373069 - 20379243 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987399`
GeneID	`130987399`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987399`
原始查询	`SmilChr06G001751`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant cysteine oxidase 3
产物	plant cysteine oxidase 3
Arabidopsis	`AT1G18490` (AT1G18490) 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative (DUF1637) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838430] identity=61.5; qcov=0.912; evalue=3.87e-93; confidence=high
Rice	`Os08g0133000` - identity=53.6; qcov=0.937; evalue=3e-77; confidence=high
GO	GO:0016702 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen)
KEGG	-
Pfam	PF07847 (PCO_ADO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987399

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057766901.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766903.1`
3	Nucleus	细胞核	0.40000	`XP_057766901.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766901.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766901.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20373615`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20378964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766901.1

266 aa

133

266

PCO_ADO

PF07847 PCO_ADO 52-264 aa

XP_057766903.1

239 aa

120

239

PCO_ADO

PF07847 PCO_ADO 52-226 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766901.1`	Pfam	`PF07847`	PCO_ADO	Family	52	264	4.1e-73	245.8	PCO_ADO
`XP_057766903.1`	Pfam	`PF07847`	PCO_ADO	Family	52	226	5.9e-64	215.9	PCO_ADO

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910918.1
AATACAGCCTATTTATACCATAAGACCCCCATAAAGTAAGCTATCATGTAACACCAATGCATGCTCTCAAAATCTAGTTTCCTTTTGGAGGTATTTATCAATATTTAGAGACATAAGTTAACTGCAAACGCCTCACTCGAAAAGATCTCCGAATGTGAGATAACAAATTTTGCGATCCCAACCCCATATTATCTGCTTTTCACGGTTGTAGAGAGGAAATGTGTTTCCACAAAAGGTTGTTGAGCGCAATGACCAGCAAG...

XM_057910920.1
CATAAAGTAAGCTATCATGTAACACCAATGCATGCTCTCAAAATCTAGTTTCCTTTTGGAGGTATTTATCAATATTTAGAGACATAAGTTAACTGCAAACGCCTCACTCGAAAAGATCTCCGAATGTGAGATAACAAATTTTGCGATCCCAACCCCATATTATCTGCTTTTCACGGTTGTAGAGAGGAAATGTGTTTCCACAAAAGGTTGTTGAGCGCAATGACCAGCAAGAAGAAAACTTCCCCCTCCGCTATTCAAGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987399
ATGTGTTTCCACAAAAGGTTGTTGAGCGCAATGACCAGCAAGAAGAAAACTTCCCCCTCCGCTATTCAAGATCTTTACGACCTCTGCACCCATACTTTTACGCCTTCAGCCGCTTCGCCGCCGTCTCTCACCGCCGTTCATAAGATCTCTTCTTTATTAGACACTATTGGTCCTGCTGATGTTGGTCTTAGTGATGCTAGCAAAGAGGATGACAGAGGTCATGGTCCTTTTGGGATCTTTTCATTCAATCGAGTAGATCG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766901.1
MCFHKRLLSAMTSKKKTSPSAIQDLYDLCTHTFTPSAASPPSLTAVHKISSLLDTIGPADVGLSDASKEDDRGHGPFGIFSFNRVDRWAQPLTYVDIHEGQNFTMCIFCFPTSSVIPLHDHPGMTVLSKVLYGSLHVKAYDWVEPARIRKIQGTENSTVRLAKLAVDKVITAPCSTSILYPRSGGNLHCFTAITPCAVLDILAPPYDEFSGRRCSYYRDYSCSSFSIEDDKSGVEKEEEYAWLAEIDTPDDLYMRPGTYT...

XP_057766903.1
MCFHKRLLSAMTSKKKTSPSAIQDLYDLCTHTFTPSAASPPSLTAVHKISSLLDTIGPADVGLSDASKEDDRGHGPFGIFSFNRVDRWAQPLTYVDIHEGQNFTMCIFCFPTSSVIPLHDHPGMTVLSKVLYGSLHVKAYDWVEPARIRKIQGTENSTVRLAKLAVDKVITAPCSTSILYPRSGGNLHCFTAITPCAVLDILAPPYDEFSGRRCSYYRDYSCSSFSRWILQPLKMIKVV

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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