Gene Card 基因详情

支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001764`

染色体: Chr06 坐标: 20619668-20622559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001764`
名称	SmilChr06G001764
描述	uncharacterized SmilChr06G001764
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20619668 - 20622559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987439`
GeneID	`130987439`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987439`
原始查询	`SmilChr06G001764`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	OsDjC20; symbol=OsDjC20; hit=Os02g0693200; species=rice; confidence=high
产物	OsDjC20; symbol=OsDjC20; hit=Os02g0693200; species=rice; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G16650` (AT5G16650) Chaperone DnaJ-domain superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831527] identity=78.7; qcov=0.871; evalue=2.34e-58; confidence=high
Rice	`Os02g0693200` (OsDjC20) - identity=71.2; qcov=0.952; evalue=5.67e-60; confidence=high
GO	GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF00226 (DnaJ)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987439

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766963.1`
2	Nucleus	细胞核	0.80000	`XP_057766963.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057766963.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766963.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766963.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

该基因暂未检索到已上线的精选 EMS CDS / LoF 突变，或 EMS 突变库仍在构建。

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766963.1

124 aa

124

DnaJ

PF00226 DnaJ 12-74 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766963.1`	Pfam	`PF00226`	DnaJ	Domain	12	74	1.4e-25	89.8	DnaJ domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910980.1
CTCTTTCTCTCATCAATGAATATTCTTCTTCTTCTCCGATCCATTTGAAGCCTCTGGTTTCATCAAGTGCTACAGCTAAGAATCTATGCATTTGATGGGAACTGAATTCTCTCTTTATTGTGAAAGCCCAACTGAGAAATATCGAAAAGCCAGTTGTGGCGATTAGAGCTCCACACCCACTATGTGTGTAATAATATCCTAAAAAGGGAAAATTGCAATTAAGTTGTTCCCCCAAAATTGAAAATCCCCATATCCGTCTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987439
ATGGACTCCAATCTCAACCCCACTTCTCACAAGGATTACTACAAGATCTTACAAGTAGATTATGATGCAACTGACGACAAGATTCGATTGAATTACCGGAAGCTCGCTTTGAAGTGGCATCCTGACAAACATAAGGGTGATGCTGCTGCTACCGCTGTATTTCAAGAAATTAATGAAGCTTATTCTGTGTTAAGTGATCCAGATAAGAGGCTTGAGTATGATTTGAATGGAAATTATGAGATCGACAAGTATACCCTACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766963.1
MDSNLNPTSHKDYYKILQVDYDATDDKIRLNYRKLALKWHPDKHKGDAAATAVFQEINEAYSVLSDPDKRLEYDLNGNYEIDKYTLREYLSRFKGMILTCNGLGISSTSKWSQPLMELNDLKEI

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

JBrowse

跳转到基因组浏览器