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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001768`

染色体: Chr06 坐标: 20645950-20649998 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001768`
名称	SmilChr06G001768
描述	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20645950 - 20649998 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987408`
GeneID	`130987408`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987408`
原始查询	`SmilChr06G001768`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
产物	probable inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g03770
Arabidopsis	`AT5G14210` (AT5G14210) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831271] identity=56.7; qcov=0.994; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os11g0308800` - identity=51.4; qcov=0.72; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF13855 (LRR_8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987408

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766916.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766916.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766916.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766916.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20646161`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B37,C13
`Chr6:20646161`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B37,C13
`Chr6:20646178`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B97,C14,C20
`Chr6:20646187`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A1,A6,B14,B27,B31,B41,B51,B89,C10,C17,C25,C29,C74,C87
`Chr6:20646193`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	170	A1,A10,A11,A14,A15,A16,A19,A2,A20,A23,A4,A5,A6,A7,A8,A9,B1,B102,B104,B105,B108,B109,B11,B111,B113,B115,B117,B118,B12,B121,B123,B124,B125,B127,B128,B13,B130,B131,B132,B133,B134,B135,B136,B137,B138,B14,B15,B16,B17,B2,B20,B21,B22,B24,B26,B27,B29,B31,B32,B34,B35,B36,B37,B4,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B5,B50,B51,B52,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B78,B8,B80,B83,B84,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C19,C20,C21,C23,C24,C25,C27,C28,C29,C31,C34,C36,C37,C4,C44,C45,C46,C48,C50,C51,C54,C55,C59,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C71,C72,C73,C74,C75,C77,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C9,D10,D11,D2,D4,D6,D8,D9
`Chr6:20646220`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B97,C20
`Chr6:20646254`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B40,C2
`Chr6:20646352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	5	A8,B5,B57,B72,B77
`Chr6:20646352`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A8,B5,B57,B72,B77
`Chr6:20646366`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B14,B27,B41,B89,C74
`Chr6:20646659`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C34
`Chr6:20646769`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B42

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766916.1

771 aa

386

771

LRR_8

LRR_1

LRR_8

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF13855 LRR_8 166-225 aa PF00560 LRR_1 190-210 aa PF13855 LRR_8 258-317 aa PF00560 LRR_1 282-304 aa PF00069 Pkinase 487-653 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 489-747 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	166	225	3.6e-22	78.6	Leucine rich repeat
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	190	210	2.2e-17	60.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF13855`	LRR_8	Repeat	258	317	3.6e-22	78.6	Leucine rich repeat
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	282	304	2.2e-17	60.1	Leucine Rich Repeat
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	487	653	6.2e-17	62.6	Protein kinase domain
`XP_057766916.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	489	747	6.6e-22	78.8	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910933.1
ATCATAATTGCACCTTCTTTGGTGACAAAAATCTTTTTGTCTGTGTATAGATTTGAAACTTAGGATTTTTAACATGTAACTGGTTTTTGTTTTCCTTTGTTTTCTCGTGTTGAGTTTCACAGTGACAGACAGTGCTCCATAACCATACCATATCACCTCAGCCATTAATGCATAGATCTAAAGACGACAAAAGAAGTTGCTACTCTCGTCTTGTTTTCTTCCATGATTATGAATGAATGAATGCATCAATGCCGGTAGCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987408
ATGGGGTGTTCAAATTACTGTGTTTTAGTGTTTCTTTCATGGCTGCTGCTTGCTTCGAGCACTCATGAGCTGAAAAGCTACGAAACGCAAGTTCTTCTTCAGCTGAGGAAGCATTTGGAGTACCCTCTGCCTCTCAGCAGCTGGGAGAATTACGATGCCGATTTCTGCAATTTGTCGTCTCCACCGCAGCTCACCATCAAATGTGAGAATGATTCTGTCACCGAGCTTCGAATCATGGGAGACAAGCCTGCAAAGGTGAG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766916.1
MGCSNYCVLVFLSWLLLASSTHELKSYETQVLLQLRKHLEYPLPLSSWENYDADFCNLSSPPQLTIKCENDSVTELRIMGDKPAKVSTEFSGFAIPNLTLSQSFSMDSFITTLTRLSSLRVVTLVALGIWGPLPDKIHRLYLLEALDMSSNFLFGLIPSQMSRMVKLRSLSFDENYFNGSVPEWLDSWSNLTVLSLKNNRLSGEVPSAVSRITALSELVLSHNLLTGKLPDLSSLSSLQLLDLRENGLDSELPSLPKGLA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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