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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001778`

染色体: Chr06 坐标: 20817192-20823550 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001778`
名称	SmilChr06G001778
描述	protein TPLATE-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20817192 - 20823550 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987403`
GeneID	`130987403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987403`
原始查询	`SmilChr06G001778`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein TPLATE-like
产物	protein TPLATE-like
Arabidopsis	`AT3G01780` (TPLATE) ARM repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:821081] identity=79.8; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0793100` - identity=69.2; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0006897 (endocytosis)
KEGG	-
Pfam	PF28631 (TPLATE_C); PF28665 (TPLATE_Ig)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057766907.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766907.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766907.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766907.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766907.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20817683`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr6:20817723`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr6:20818074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B24,B69,C17,C30
`Chr6:20820076`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B82
`Chr6:20820098`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr6:20820157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B136,B24,B69,C17,C30
`Chr6:20821845`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C25
`Chr6:20822466`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr6:20822538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B46
`Chr6:20822653`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr6:20822839`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B101,B82
`Chr6:20822950`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B56,B96,C85

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766907.1

1165 aa

582

1165

TPLATE_Ig

TPLATE_C

PF28665 TPLATE_Ig 769-910 aa PF28631 TPLATE_C 917-1074 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766907.1`	Pfam	`PF28665`	TPLATE_Ig	Domain	769	910	2.1e-73	245.5	TPLATE immunoglobulin-like domain
`XP_057766907.1`	Pfam	`PF28631`	TPLATE_C	Domain	917	1074	7.6e-79	263.8	TPLATE C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910924.1
TTTGTTTGTCTACGGAAATCATAGTAGCGTTTTACTTCAACTGAGCTGGCGTTAAATGGGCACCTGCGCTCCGCCGTGAAAACTAGTCCATCGTCAACTCCAAACCGCCGGGGATAATCAACCCCGGAAGCCGCCGTTCAATCTCTCAATTTCCCTCCAAGAAAATGATGCGGAACCTACTCAAGCTCTGATCAGTTCAATTGAAGTAATTCACCACCAGTTCAAGTTCTGAACTGCCATCTCCACTGTGAAAATGGACA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987403
ATGGACATACTTTTCGCTCAGATCCAAGCGGACCTTCGCTCCAACGACGCGCTCCGCCAGTCCGGAGCATTGCTCCAAGCACTACAACAGTCCGCCGCCGGCCGAGACATCTCGGTGCTCGCCAAATCCGCCGTTGAGGAGATCGTCGCCTCGCCTGCCTCCGCCGTCTCCAAAAAGCTCGCCTTCGACCTAATCCGCTCCACTCGCCTCACTCCCGATCTATGGGAAATCGTGTGCGCCGGCGTCCGGAAGGATCTCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766907.1
MDILFAQIQADLRSNDALRQSGALLQALQQSAAGRDISVLAKSAVEEIVASPASAVSKKLAFDLIRSTRLTPDLWEIVCAGVRKDLDFPDPDVTAAAVSILAAVPSYRLGKLINDCHKEISACFDSPSDNLRFSITETLGCILARDDLVTLCENNINLLDRVSNWWNRMAQNMLDKSDSVSKVAFESIGKLFQEFESKKMSRLAGDKLVDTENSVAIRSNWISSMVDFVWKKRSALMSRSIILPIESFRATIFPLVYAVK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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