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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001781`

染色体: Chr06 坐标: 20834696-20837307 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001781`
名称	SmilChr06G001781
描述	kelch repeat-containing protein At3g27220-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20834696 - 20837307 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987422`
GeneID	`130987422`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987422`
原始查询	`SmilChr06G001781`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	kelch repeat-containing protein At3g27220-like
产物	kelch repeat-containing protein At3g27220-like
Arabidopsis	`AT1G51540` (AT1G51540) Galactose oxidase/kelch repeat superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841579] identity=55.5; qcov=0.979; evalue=1.28e-148; confidence=high
Rice	`Os04g0487100` - identity=50.5; qcov=1; evalue=2.38e-142; confidence=high
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF07646 (Kelch_2); PF24681 (Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987422

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766937.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057766936.1`
3	Endoplasmic reticulum lumen	内质网腔	0.20000	`XP_057766937.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766936.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766936.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20835042`	`A`	`AC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	B131,B40,B90,B92,C14
`Chr6:20835042`	`A`	`AC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	B131,B40,B90,B92,C14
`Chr6:20835260`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	244	A1,A10,A11,A13,A14,A15,A16,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A6,A8,A9,B1,B10,B100,B101,B102,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B131,B132,B133,B134,B135,B137,B138,B139,B14,B140,B15,B16,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B3,B30,B31,B32,B34,B35,B36,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B56,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B67,B68,B69,B7,B70,B71,B73,B75,B76,B77,B78,B79,B8,B80,B81,B82,B83,B84,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B96,B97,B98,B99,C1,C10,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C18,C19,C2,C20,C21,C22,C23,C24,C25,C26,C27,C28,C29,C3,C30,C31,C32,C33,C34,C35,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C41,C42,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C78,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D11,D2,D3,D4,D5,D7,D8,D9
`Chr6:20835310`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B140,B33,C27,C63,D10
`Chr6:20835394`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B24,C17,C30,C36,C74
`Chr6:20835738`	`AT`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B80
`Chr6:20835738`	`AT`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20835760`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,B61,C47
`Chr6:20836224`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C36,C74
`Chr6:20836351`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20836978`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr6:20837019`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A24,A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766936.1

436 aa

218

436

Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7

Kelch_2

PF24681 Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7 117-288 aa PF07646 Kelch_2 212-260 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766936.1`	Pfam	`PF24681`	Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7	Repeat	117	288	5.7e-25	88.6	KLHDC2/KLHL20/DRC7 Kelch-repeats domain
`XP_057766936.1`	Pfam	`PF07646`	Kelch_2	Repeat	212	260	2.8e-15	56.1	Kelch motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910953.1
GAGGTTGGCAGAAAACCGTCTGTATCTGAGGTGGTTTGGCGGTGAATTTGAATGAGTGAGAAAGGAAAGCAAAGGAAACCATTGGCGCCCCACTCTCGAAACATGATCTGCTTTACTATAATTTACTACTTTGCTTTCCTCATCAACTTCTCATCGCCTTTCTTCGATCTTCAATCACTATGCTGTCTGCCGGAAAACGCGCTTCCGCTAAATCCACACTCATTTTTATGCTTCTATCCCTTGTTGGGATCGCTTTAACG...

XM_057910954.1
TCTGAGGTGGTTTGGCGGTGAATTTGAATGAGTGAGAAAGGAAAGCAAAGGAAACCATTGGCGCCCCACTCTCGAAACATGATCTGCTTTACTATAATTTACTACTTTGCTTTCCTCATCAACTTCTCATCGCCTTTCTTCGATCTTCAATCACTATGCTGTCTGCCGGAAAACGCGCTTCCGCTAAATCCACACTCATTTTTATGCTTCTATCCCTTGTTGGGATCGCTTTAACGGTGGATTTCTTCTGGGCCTCGTCG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130987422
ATGCTGTCTGCCGGAAAACGCGCTTCCGCTAAATCCACACTCATTTTTATGCTTCTATCCCTTGTTGGGATCGCTTTAACGGTGGATTTCTTCTGGGCCTCGTCGTCGTCTTCTTCTCCTTCCTCGTCCTCGCCTTTTTTGTCGAACTGGGCTCAGGAGAAAAATCAAATCTTTGTATTTTCCAAACCTAAAATCGATAACGAAAAACAGGAGAAGGTAGAAGATGAAGCCAAGAAGAATAATGTCCCTGAGCTGGAATT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057766936.1
MLSAGKRASAKSTLIFMLLSLVGIALTVDFFWASSSSSSPSSSSPFLSNWAQEKNQIFVFSKPKIDNEKQEKVEDEAKKNNVPELELSGTFADLPAPELEWEQMPSAPVPRLDGSAIQIEDLLYVFCGYGTLDHVHSHVDVYNFTARNWTERFETPKEMAHSHLGVASDGRRYVYIVSGQHGPQCTAPPVALSFVLDTKTRKWESFPSLPAPRYAPATQLWRGRLHVMGGSKENRHTPGTDHWSIAVKNGKAIEKEWRKE...

XP_057766937.1
MLSAGKRASAKSTLIFMLLSLVGIALTVDFFWASSSSSSPSSSSPFLSNWAQEKNQIFVFSKPKIDNEKQEKVEDEAKKNNVPELELSGTFADLPAPELEWEQMPSAPVPRLDGSAIQIEDLLYVFCGYGTLDHVMCIPTSMSTISRLEIGLRDLRRQKRWRIRIWEWQVMEEDMCTSCLGSMALSARLLRWLFHLSSTRRRGSGRAFPHCRLLATQLWRGRLHVMGGSKENRHTPGTDHWSIAVKNGKAIEKEWRKEMP...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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