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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001782`

染色体: Chr06 坐标: 20848311-20850756 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001782`
名称	SmilChr06G001782
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20848311 - 20850756 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990629`
GeneID	`130990629`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990629`
原始查询	`SmilChr06G001782`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=34.5; qcov=0.856; evalue=4.71e-61; confidence=low
Rice	`Os01g0852650` - identity=27.9; qcov=0.863; evalue=1.4e-54; confidence=low
GO	GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF10551 (MULE); PF21056 (ZSWIM1-3_RNaseH-like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990629

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770834.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770834.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770834.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770834.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770834.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20848384`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B25
`Chr6:20848406`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B111,B63,B83,C27
`Chr6:20848420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B25,D10
`Chr6:20848421`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B34,B86,C75
`Chr6:20849154`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:20849172`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	87	A10,A15,A6,A7,A8,B10,B100,B102,B104,B109,B112,B113,B114,B119,B12,B122,B123,B125,B129,B133,B137,B138,B15,B17,B19,B27,B28,B29,B32,B34,B35,B38,B4,B41,B44,B45,B46,B5,B53,B56,B6,B62,B63,B65,B66,B70,B73,B79,B80,B84,B89,B90,B92,B96,B97,B99,C1,C17,C19,C20,C3,C30,C36,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C53,C57,C59,C6,C60,C62,C63,C67,C72,C76,C77,C8,C81,C87,D1,D11,D4,D6
`Chr6:20849226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B84
`Chr6:20849242`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	3	B4,B55,C7
`Chr6:20849242`	`CTA`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	3	B4,B55,C7
`Chr6:20849280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C62
`Chr6:20849287`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C4,D5
`Chr6:20849290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B70,B82,C25,C55

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770834.1

444 aa

222

444

FAR1

ZSWIM1-3_RNaseH-like

MULE

PF03101 FAR1 83-178 aa PF21056 ZSWIM1-3_RNaseH-like 270-379 aa PF10551 MULE 299-391 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770834.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	83	178	1.8e-13	51.7	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770834.1`	Pfam	`PF21056`	ZSWIM1-3_RNaseH-like	Domain	270	379	1.9e-07	31.8	Zinc finger SWIM domain-containing protein 1/3, RNaseH-like domain
`XP_057770834.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	299	391	3.9e-27	95.2	MULE transposase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914851.1
ATGGGGGATTCACCTATGTTTTTCAGCGAGGGATTTAGAGCGAGAAATTGGGAATTCATTTTTGGGGTTCTTCCAGTTTCTGGCGAAAAGGACCACGGCACTGGTTCTTCCGATCTGAATCCAGTTTCTCACCATGTTCATAGATCTCGTGATGAACAATATATTATTGACTTAGTCACACCCACGTGTGATCCTCAATTGATTCCATTTGAGGGACAAATATTTCCTACATTGGAGCTGGGTGTCAAATTCTATGAGGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990629
ATGGGGGATTCACCTATGTTTTTCAGCGAGGGATTTAGAGCGAGAAATTGGGAATTCATTTTTGGGGTTCTTCCAGTTTCTGGCGAAAAGGACCACGGCACTGGTTCTTCCGATCTGAATCCAGTTTCTCACCATGTTCATAGATCTCGTGATGAACAATATATTATTGACTTAGTCACACCCACGTGTGATCCTCAATTGATTCCATTTGAGGGACAAATATTTCCTACATTGGAGCTGGGTGTCAAATTCTATGAGGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770834.1
MGDSPMFFSEGFRARNWEFIFGVLPVSGEKDHGTGSSDLNPVSHHVHRSRDEQYIIDLVTPTCDPQLIPFEGQIFPTLELGVKFYEEYADAAGFETRLSTPKKAEDGTMLYRYVLCNRAGLKPKKKIPSNTKGNEPKKQRQTVSIRVDCMARIVLRHAGNRGYRVNTFDEHHTHNMVPEGQRHLMNSKRNVNYIHQMMMLTGMKANIGPMKTFRFYKELVGGYDDVGCTAQDFKNYGRDLRAFSDGVDARILVDNFRDKQ...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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