当前解析结果
SmilChr06G001785| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001785 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001785 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001785 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 20882628 - 20896498 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130990630 |
|---|---|
| GeneID | 130990630 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130990630 |
| 原始查询 | SmilChr06G001785 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130990630 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057770835.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.60000 | XP_057770835.1 |
| 3 | Nucleoplasm | 核质 | 0.20000 | XP_057770835.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057770835.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057770835.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:20883279 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 17 | A13,B115,B123,B130,B41,B46,B61,B78,B85,B97,C10,C16,C22,C23,C56,C65,C9 |
Chr6:20883320 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B101,B127,B86,C76 |
Chr6:20883321 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B113,B68,C46 |
Chr6:20883464 |
AC |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 4 | B122,B18,B98,C51 |
Chr6:20883464 |
AC |
A |
1bp_deletion | CDS_variant | 4 | B122,B18,B98,C51 |
Chr6:20883472 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | D10,D11 |
Chr6:20883556 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B90,C27 |
Chr6:20883693 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C8 |
Chr6:20883733 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B115,B132,B89,B90,B92 |
Chr6:20883736 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B105,B114,B7,C54,C82 |
Chr6:20883750 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B106,C8,D6 |
Chr6:20883758 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C27 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。