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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001788`

染色体: Chr06 坐标: 20930430-20932697 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001788`
名称	SmilChr06G001788
描述	ubiquinol oxidase 3, mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20930430 - 20932697 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987442`
GeneID	`130987442`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987442`
原始查询	`SmilChr06G001788`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ubiquinol oxidase 3, mitochondrial-like
产物	ubiquinol oxidase 3%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT1G32350` (AOX1D) alternative oxidase 1D [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:840127] identity=75.3; qcov=0.949; evalue=3.55e-44; confidence=medium
Rice	`Os04g0600200` (AOX1A) - identity=72; qcov=0.949; evalue=2.47e-43; confidence=medium
GO	GO:0005739 (mitochondrion); GO:0009916 (alternative oxidase activity); GO:0010230 (alternative respiration)
KEGG	-
Pfam	PF01786 (AOX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987442

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	0.60000	`XP_057766966.1`
2	Chloroplast thylakoid	类囊体	0.60000	`XP_057766966.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057766966.1`
4	Chloroplast thylakoid membrane	类囊体膜	0.20000	`XP_057766966.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766966.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20932141`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B42,B43
`Chr6:20932186`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C10,C52
`Chr6:20932207`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B26,B3,C83
`Chr6:20932247`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B108,B50,B72
`Chr6:20932249`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B60
`Chr6:20932282`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:20932313`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B83,C10,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766966.1

98 aa

AOX

PF01786 AOX 1-93 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766966.1`	Pfam	`PF01786`	AOX	Domain	1	93	7.2e-34	118.0	Alternative oxidase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089729.1
GTTATTGTAAAAATTTTAAATGAAATTTCTTTTTTAACCTAATCTAATTCCCTCCAAACCCCTTCCCCCAGTCCGCTGCGCCATCCCCCTGGTCTGTCGCGCCTCCGTCCAGCTCCCCCCAATCCCCCGCGACCCTGGTCTGCTGCGTCTCCGTCCGCCCCTGAATCAGTGTCTAGTTTCTCACCCAACCAAACCCTAACTCTCTTTCTCTCTCCCAAACCGCAGCGCTTCTGTCCGCCTCTCCCGGGTCCACCGCGCCT...

XR_009089731.1
AAAAATTTTAAATGAAATTTCTTTTTTAACCTAATCTAATTCCCTCCAAACCCCTTCCCCCAGTCCGCTGCGCCATCCCCCTGGTCTGTCGCGCCTCCGTCCAGCTCCCCCCAATCCCCCGCGACCCTGGTCTGCTGCGTCTCCGTCCGCCCCTGAATCAGTGTCTAGTTTCTCACCCAACCAAACCCTAACTCTCTTTCTCTCTCCCAAACCGCAGCGCTTCTGTCCGCCTCTCCCGGGTCCACCGCGCCTCCGGTCTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987442
ATGCATCTGATGACCTTCCTGGAACTGTCGCAGCCGAAATGGACGGAGCGTGCCCCAGTTATCGCGATGCAGGGCGTCTTCTTCAACGCCTATTTCGCCGCCTACCTGCTGTCGCCCAAGCTTGCCCACCGCATCGTCGGATACCTCGAGGAAGAGGCAGTCAATTCCTACACCGAGTTTCCCAACGATCTGGAGAAGGGGATCGTCGAGAATCAGCCGGCGTCGGCCATCGCCATCGATTACTGGCGCCTGCCGCCCAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766966.1
MHLMTFLELSQPKWTERAPVIAMQGVFFNAYFAAYLLSPKLAHRIVGYLEEEAVNSYTEFPNDLEKGIVENQPASAIAIDYWRLPPNPTSLRDRNITP

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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