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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001792`

染色体: Chr06 坐标: 20970158-20971485 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001792`
名称	SmilChr06G001792
描述	TLC domain-containing protein At5g14285
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20970158 - 20971485 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987433`
GeneID	`130987433`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987433`
原始查询	`SmilChr06G001792`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	TLC domain-containing protein At5g14285
产物	TLC domain-containing protein At5g14285
Arabidopsis	`AT5G14285` (AT5G14285) DNA-binding storekeeper [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:28721155] identity=60.6; qcov=1.02; evalue=7.69e-107; confidence=high
Rice	`Os05g0302600` - identity=59.4; qcov=0.944; evalue=2.95e-78; confidence=high
GO	GO:0016020 (membrane)
KEGG	-
Pfam	PF03798 (TRAM_LAG1_CLN8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987433

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766957.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057766957.1`
3	Golgi apparatus	高尔基体	0.20000	`XP_057766957.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766957.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766957.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20970794`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B41,B44,B91,C51,C74
`Chr6:20970805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr6:20970826`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B78
`Chr6:20971074`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,A21,C40,C53
`Chr6:20971201`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B90,B91,B92

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766957.1

248 aa

124

248

TRAM_LAG1_CLN8

PF03798 TRAM_LAG1_CLN8 43-232 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766957.1`	Pfam	`PF03798`	TRAM_LAG1_CLN8	Domain	43	232	4.8e-20	73.0	TLC domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910974.1
TTTCACTCAATATATACATATGTAATGGAAAATAATTACAAAATGCTCCTTTAACAAATGAGAAAATTATGAACTGTAATATAATTAATATCGAGAATCCAGATGTTTCTTCAATTACGAGGAGAATCTAGTATTTTATATGATTATTGTATTCTGCAATTATTGTAGGGTAATTATCCTGAAATTCGTTTTTGAGCTGAACAAGCAGAGTGACCTAATCTCAATGATTTTGTGAAGTGAGGTGATAATGGAAGCGTGTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987433
ATGGACCTTCAATTTCCGCCAACCTCGAATCCCCTCTCCCTCTTCTTCGCCGGCTATTTGATCCTCTACCTCATTGCTTATTCTGTCCTCTTCCGCAGCTGGGCCTCCAAGCTCCGCCCCGAGGCTTCCAGCTGCGCCATATCCCTTGCTCACGGCACGCCCGCCGTGTTCCTCGCCGCCCGCGCCATCCTCTCCGACCCCGCCCGCGATTTCCACTCCGCCAACACGCCGCTCCAGAATCTCGTCTTGGATTACAGCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766957.1
MDLQFPPTSNPLSLFFAGYLILYLIAYSVLFRSWASKLRPEASSCAISLAHGTPAVFLAARAILSDPARDFHSANTPLQNLVLDYSIAYFLMDLVHYLIFYPTDVLFIGHHLATLFVFVTCRYVVYHGAFAILVLLVLAEVTSFCQNVWTLASARKSDVEFAAKVFDLLSPPFYALYSVVRGFVGPYFVYRMFAFYVTGAADAVIPKWVWISWLLVVVTAISVSILWIVNLWVVFFREDKKKAEKKVR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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