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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001793`

染色体: Chr06 坐标: 20976122-20980009 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001793`
名称	SmilChr06G001793
描述	lysine histidine transporter 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	20976122 - 20980009 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987421`
GeneID	`130987421`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987421`
原始查询	`SmilChr06G001793`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	lysine histidine transporter 1-like
产物	lysine histidine transporter 1-like
Arabidopsis	`AT5G40780` (LHT1) lysine histidine transporter 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834078] identity=79.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os08g0127100` (OsHT) - identity=82.4; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane)
KEGG	-
Pfam	PF01490 (Aa_trans); PF03222 (Trp_Tyr_perm)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987421

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057766935.1`
2	Vesicle	囊泡	0.20000	`XP_057766935.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766935.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766935.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766935.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:20977254`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr6:20977254`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr6:20977256`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr6:20977256`	`T`	`TGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr6:20977257`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr6:20977257`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr6:20977268`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B69
`Chr6:20977268`	`A`	`AGG`	2bp_insertion	CDS_variant	1	B69
`Chr6:20977313`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B32
`Chr6:20977436`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C34,C83
`Chr6:20977743`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A1
`Chr6:20978148`	`TCA`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A11,B37,B61,C1,C3,C34,C40

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766935.1

446 aa

223

446

Aa_trans

Trp_Tyr_perm

PF01490 Aa_trans 35-431 aa PF03222 Trp_Tyr_perm 40-171 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766935.1`	Pfam	`PF01490`	Aa_trans	Domain	35	431	7e-113	378.1	Transmembrane amino acid transporter protein
`XP_057766935.1`	Pfam	`PF03222`	Trp_Tyr_perm	Family	40	171	2.2e-08	34.4	Tryptophan/tyrosine permease family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910952.1
GCTCTCTCTCTCTCTTGTTGAAGCTCATGGGAACTGAAAGCAAGAACGACGATTACACAAAAAATGTGGATAATCGGACAGCAGAAGAGAAGGCAATCGATGCGTGGTTGCCTATCACTTCTTCGAGAAATGCAAAATGGTGGTACTCAGCTTTCCACAATGTCACAGCCATGGTTGGAGCTGGGGTTCTCAGTCTCCCTTACGCCATGTCTGAACTAGGATGGGGGCCTGGAGTAGCTGTGATGGTCATATCTTGGATC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987421
ATGGGAACTGAAAGCAAGAACGACGATTACACAAAAAATGTGGATAATCGGACAGCAGAAGAGAAGGCAATCGATGCGTGGTTGCCTATCACTTCTTCGAGAAATGCAAAATGGTGGTACTCAGCTTTCCACAATGTCACAGCCATGGTTGGAGCTGGGGTTCTCAGTCTCCCTTACGCCATGTCTGAACTAGGATGGGGGCCTGGAGTAGCTGTGATGGTCATATCTTGGATCGTCACCTTCTACACGTTGTGGCAGAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766935.1
MGTESKNDDYTKNVDNRTAEEKAIDAWLPITSSRNAKWWYSAFHNVTAMVGAGVLSLPYAMSELGWGPGVAVMVISWIVTFYTLWQMVEMHEMVPGKRFDRYHELGQHAFGEKLGLYIVVPQQLVVEVGVDIVYMVTGGKSLKKFHDTVCPECKDIKLTFFIMIFASVHFVLSHLPNFNSISGVSLAAAVMSLSYSTIAWGASLKKGVQPNVQYGYRATTTAGTVFNFFSALGDVAFAYAGHNVVLEIQATIPSTPEKPS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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