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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001806`

染色体: Chr06 坐标: 21233029-21236015 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001806`
名称	SmilChr06G001806
描述	F-box protein At3g27290-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21233029 - 21236015 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987418`
GeneID	`130987418`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987418`
原始查询	`SmilChr06G001806`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	F-box protein At3g27290-like
产物	F-box protein At3g27290-like
Arabidopsis	`AT3G26000` (AT3G26000) Ribonuclease inhibitor [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:822197] identity=32.8; qcov=0.979; evalue=1.1e-63; confidence=low
Rice	`Os04g0485800` (OsFbox225) - identity=32.4; qcov=0.891; evalue=6.63e-57; confidence=low
GO	GO:0005515 (protein binding); GO:0005737 (cytoplasm)
KEGG	-
Pfam	PF12937 (F-box-like); PF28114 (At3g27290_F_box_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987418

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057766931.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057766931.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057766931.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766931.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766931.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21233855`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr6:21233965`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C48,D4
`Chr6:21234036`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr6:21234272`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B72,B80
`Chr6:21234409`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B14,B59,B72,B80
`Chr6:21235057`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B136,B140
`Chr6:21235124`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr6:21235165`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C46
`Chr6:21235263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B112,B132,C1
`Chr6:21235411`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B101,B136,B140
`Chr6:21235504`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C36,C40,D11
`Chr6:21235517`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766931.1

485 aa

242

485

F-box-like

At3g27290_F_box_C

PF12937 F-box-like 206-248 aa PF28114 At3g27290_F_box_C 385-456 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766931.1`	Pfam	`PF12937`	F-box-like	Domain	206	248	1.8e-06	28.3	F-box-like
`XP_057766931.1`	Pfam	`PF28114`	At3g27290_F_box_C	Domain	385	456	1.7e-23	83.5	At3g27290 F-box protein C-terminal domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057910948.1
ACAAATTAACATTCTCCCACCACGCGTCTCTCTTTCTCATACTGGTACGCCGATTTTCTCTCTCATAACTCGCACCTCCCACCCCCTTAATCGGCTTCTGTTGCTCCTTCCCTCACAACTCACAGTATATTTAAGAATACACATATTACACCTACGTCTCTCCACATAGTCTTTTTTGGCTTTTCTGTTGCGCCAACTATCTAATTTGCACACACCAAGTAATAACCTGGGTCAAAAGGATTGATTGCTGCAGGCGATTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987418
ATGGCGTTGAGTGAAGAAGAGAATGTGTGTGGTTTTGATGATGGATTTTTGGTGGAGGAATGCGAAGCTGTAGAAAAGATTGGATTTTTGGTGGATTTTGATGATTCAAAATCTGAAAATGGTTGTGAAGATGTTGTTGATAATTTACCAAATGATCCTTTTGGGATGGAGGTCAATATGGGCATGGAAAACGATCCAATTCTTGTGGATTTCAATCCAAGTTTGCCTACAGATGATTTCGACATAGAGGCCGCTCTCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766931.1
MALSEEENVCGFDDGFLVEECEAVEKIGFLVDFDDSKSENGCEDVVDNLPNDPFGMEVNMGMENDPILVDFNPSLPTDDFDIEAALAAIAGLIEDFGLKAYGFETDEADEDCGDGSSNLKAAEDEGIDDNKFFAELNFVWSSSMEYEGEDRENELVDAGPVMYVEDGTSYGDSTTMLGGGMDDLMCFGCEKYGIEHVKSESDVGVDIIIFVLEHLDLGIKDLLSIERVCRSLRDAVRKDPYLWTSIHIDYPLSQKITNED...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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