当前解析结果
SmilChr06G001807| 统一新 Gene ID | SmilChr06G001807 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr06G001807 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr06G001807 |
| 染色体 / SeqID | Chr06 / NC_080392.1 |
| 坐标与链方向 | 21245021 - 21245861 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130987438 |
|---|---|
| GeneID | 130987438 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130987438 |
| 原始查询 | SmilChr06G001807 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130987438 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057766961.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057766961.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057766961.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057766961.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057766961.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr6:21245133 |
C |
CAA |
2bp_insertion | frameshift_variant | 1 | A24 |
Chr6:21245133 |
C |
CAA |
2bp_insertion | CDS_variant | 1 | A24 |
Chr6:21245245 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B64,C21 |
Chr6:21245301 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | A22,B13,B16,C12,C16 |
Chr6:21245325 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B89,C10,C43 |
Chr6:21245332 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B129,C50 |
Chr6:21245353 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B129 |
Chr6:21245361 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | A21 |
Chr6:21245361 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A21 |
Chr6:21245402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 2 | A7,C53 |
Chr6:21245402 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A7,C53 |
Chr6:21245429 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 26 | B102,B127,B128,B131,B133,B15,B18,B28,B31,B35,B38,B53,B60,B93,C33,C40,C43,C49,C50,C54,C56,C58,C76,C8,D5,D7 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。