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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001810`

染色体: Chr06 坐标: 21273324-21275609 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001810`
名称	SmilChr06G001810
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21273324 - 21275609 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990633`
GeneID	`130990633`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990633`
原始查询	`SmilChr06G001810`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
产物	protein FAR1-RELATED SEQUENCE 5-like
Arabidopsis	`AT4G38180` (FRS5) FAR1-related sequence 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:829974] identity=31.8; qcov=0.756; evalue=8.7e-95; confidence=low
Rice	`Os06g0166100` - identity=37.1; qcov=0.777; evalue=7.97e-132; confidence=medium
GO	GO:0008270 (zinc ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF03101 (FAR1); PF04434 (SWIM); PF10551 (MULE)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990633

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770840.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770840.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770840.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770840.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057770840.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21273372`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B95
`Chr6:21273398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	A24,A7,C78
`Chr6:21273398`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,A7,C78
`Chr6:21273431`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B3,C80
`Chr6:21273468`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C61
`Chr6:21273471`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	11	A18,A19,B113,B37,B65,B9,C49,C5,C80,C85,D11
`Chr6:21273476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	2	B134,C73
`Chr6:21273476`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B134,C73
`Chr6:21273477`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C87
`Chr6:21273477`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C87
`Chr6:21273491`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A14,A15,A22,B29,B47,B63,B65,B71,C29,C50,C54,C58,D2,D6
`Chr6:21273511`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C64,D8

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770840.1

761 aa

380

761

FAR1

MULE

SWIM

PF03101 FAR1 70-158 aa PF10551 MULE 281-375 aa PF04434 SWIM 573-598 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770840.1`	Pfam	`PF03101`	FAR1	Domain	70	158	6.1e-17	62.8	FAR1 DNA-binding domain
`XP_057770840.1`	Pfam	`PF10551`	MULE	Domain	281	375	2.6e-26	92.5	MULE transposase domain
`XP_057770840.1`	Pfam	`PF04434`	SWIM	Domain	573	598	2.2e-08	34.1	SWIM zinc finger

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914857.1
ATGGTTATTGATTTGAATGTTACTGATGACGGATTTGATGATGAAGAAATTGAGAATGATTTTGAGGGCAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGAGATTATAGAATCAGATCTCCATCTGGAGTTTGAGTCATATAAGGCAATAAGAAATGAACTTGGGGAAAAATTGCAGGTTGGTGTTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACTTACAATATGGTGTTTTAAGTGGATTTAGTATTAAGAAGGGAAGCCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990633
ATGGTTATTGATTTGAATGTTACTGATGACGGATTTGATGATGAAGAAATTGAGAATGATTTTGAGGGCAATGAATGTAGCTTGTCTGAAGAGATTATAGAATCAGATCTCCATCTGGAGTTTGAGTCATATAAGGCAATAAGAAATGAACTTGGGGAAAAATTGCAGGTTGGTGTTGTTTATGATAGTTTGGATGTGATTTATATTTTGTACTTACAATATGGTGTTTTAAGTGGATTTAGTATTAAGAAGGGAAGCCA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770840.1
MVIDLNVTDDGFDDEEIENDFEGNECSLSEEIIESDLHLEFESYKAIRNELGEKLQVGVVYDSLDVIYILYLQYGVLSGFSIKKGSQKRFDNSDDLRLKVYHCSCEGYPDNKRSVGRIACYKKQVSRTNCKARLRVVRGEEGLWTVTVFFNQHNHELVSPDQCYTLRSARQMSHAKKSVLDALRSVGIKISSAYRFMEKEAGGRLNVGFTKKDAYAHVNLSKKQTKLENGDANALLKYFIGKGNSETNFYWNVDLDDDGR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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