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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001821`

染色体: Chr06 坐标: 21356037-21358885 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001821`
名称	SmilChr06G001821
描述	methionine aminopeptidase 1A-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21356037 - 21358885 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987463`
GeneID	`130987463`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987463`
原始查询	`SmilChr06G001821`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	methionine aminopeptidase 1A-like
产物	methionine aminopeptidase 1A-like
Arabidopsis	`AT2G45240` (MAP1A) methionine aminopeptidase 1A [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819132] identity=62.8; qcov=0.716; evalue=9.42e-31; confidence=medium
Rice	`Os10g0508400` - identity=48.7; qcov=0.716; evalue=2.69e-22; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF15801 (zf-C6H2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987463

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057766975.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057766975.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766975.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766975.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057766975.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21356828`	`G`	`GT`	1bp_insertion	frameshift_variant	3	B4,C20,C50
`Chr6:21356828`	`G`	`GT`	1bp_insertion	CDS_variant	3	B4,C20,C50
`Chr6:21356843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B38,C13
`Chr6:21356864`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	14	A14,A6,B48,B52,B53,B54,B82,B89,C21,C36,C45,C52,C76,D11
`Chr6:21356876`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C60
`Chr6:21356879`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B3,B87,B92,C50,C7,D2
`Chr6:21356896`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B87,B92,C50,C7
`Chr6:21357264`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C55,D9
`Chr6:21357302`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B69,C55
`Chr6:21357610`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr6:21357611`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C66
`Chr6:21357669`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B84,C6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766975.1

109 aa

109

zf-C6H2

PF15801 zf-C6H2 31-64 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766975.1`	Pfam	`PF15801`	zf-C6H2	Domain	31	64	2.2e-13	50.8	zf-MYND-like zinc finger, mRNA-binding

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XR_009089761.1
TTTTCCAAAGGACTTCTTTTCGTGAAAGAGATTACTCATGTTTTCAATGTGTATTATAGCTTGCCTTTGATTGCTATGTCTTTTCTATATAAATCATGGCACACAAGTGTTCTACTTCTCAGAGAATATATGTTCTTTTATTTCTATTACAGGAGCTGGTCTGAGATGGGAAAGTTTAAGGAAATGTTCTTTTATATTCTCCCAAATTGTATATTATCCAATTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCTCTTTTCTATTGA...

XR_009089762.1
TTTTCCAAAGGACTTCTTTTCGTGAAAGAGATTACTCATGTTTTCAATGTGTATTATAGCTTGCCTTTGATTGCTATGTCTTTTCTATATAAATCATGGCACACAAGTGTTCTACTTCTCAGAGAATATATGTTCTTTTATTTCTATTACAGGAGCTGGTCTGAGATGGGAAAGTTTAAGGAAATGTTCTTTTATATTCTCCCAAATTGTATATTATCCAATTCGAAGCTAAGTTTCCTATCCCATCTCTTTTCTATTGA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987463
ATGTTAATTAGTGTTTCTGATTTTGCTGCAGGTTATTTCGGAGAAGAACAGGAAAGAGATCTCCAAGTACAGGCTATTTTGGAGAAGAACAGGTGCCCCAAGTGCGTAGAACTAAAGCTTCGCCGTGAAGGTGCTGCTTTCTGTTCCCAAGAGTGTTTCAAGGCATCCTGGAGTTCCCATAAATCTGTTCACTTGAATGCAAAATCTTCTTTAATTGCATCTGAAAGTTATAGTGAACAGAACTTAGGTCTGCCGGGTGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766975.1
MLISVSDFAAGYFGEEQERDLQVQAILEKNRCPKCVELKLRREGAAFCSQECFKASWSSHKSVHLNAKSSLIASESYSEQNLGLPGDGWLYCLIEGQAQTPKLPHFDWF

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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