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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001823`

染色体: Chr06 坐标: 21409306-21410664 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001823`
名称	SmilChr06G001823
描述	uncharacterized SmilChr06G001823
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21409306 - 21410664 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990637`
GeneID	`130990637`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990637`
原始查询	`SmilChr06G001823`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
产物	nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861]; symbol=AT2G13770; hit=AT2G13770; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT2G13770` (AT2G13770) nuclease [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:815861] identity=32.1; qcov=0.892; evalue=6.99e-40; confidence=low
Rice	`Os01g0872900` - identity=41.8; qcov=0.434; evalue=3.81e-28; confidence=low
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04827 (Plant_tran)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990637

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770844.1`
2	Chromosome	染色体	0.60000	`XP_057770844.1`
3	Telomere	端粒	0.40000	`XP_057770844.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057770844.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057770844.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21409330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B17
`Chr6:21409330`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B17
`Chr6:21409389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	22	A14,A15,B100,B107,B120,B45,B46,B54,B63,B65,B71,B79,B83,C15,C16,C21,C24,C29,C50,C54,C57,D6
`Chr6:21409400`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A16,C26
`Chr6:21409441`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:21409482`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	5	B131,B24,C17,C30,C74
`Chr6:21409482`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	5	B131,B24,C17,C30,C74
`Chr6:21409497`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	179	A11,A13,A14,A18,A20,A23,A24,A25,A3,A4,A5,A7,A8,A9,B1,B100,B102,B104,B106,B108,B109,B110,B111,B112,B113,B115,B117,B118,B119,B120,B121,B122,B123,B124,B125,B127,B128,B129,B13,B131,B132,B133,B136,B137,B138,B139,B140,B18,B19,B2,B20,B21,B22,B23,B24,B28,B3,B30,B31,B32,B33,B34,B35,B36,B37,B38,B39,B41,B42,B43,B44,B46,B48,B49,B5,B50,B52,B53,B54,B55,B57,B58,B59,B6,B60,B61,B62,B63,B65,B66,B67,B68,B7,B70,B72,B73,B75,B76,B78,B79,B80,B82,B85,B86,B87,B88,B89,B9,B90,B91,B92,B93,B94,B95,B98,B99,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C16,C17,C21,C22,C23,C25,C26,C28,C3,C30,C33,C34,C36,C38,C39,C4,C40,C43,C46,C47,C48,C49,C5,C50,C51,C52,C53,C58,C59,C60,C61,C62,C63,C65,C67,C69,C70,C71,C74,C76,C77,C78,C79,C80,C82,C83,C84,C85,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D5,D8
`Chr6:21409530`	`GT`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	26	A14,A15,B100,B107,B120,B29,B45,B46,B54,B63,B65,B71,B72,B79,B83,C15,C16,C21,C24,C29,C50,C54,C57,C58,D2,D6
`Chr6:21409601`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	6	B131,B24,C14,C17,C30,C74
`Chr6:21409615`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B112,B132
`Chr6:21409647`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057770844.1

325 aa

162

325

Plant_tran

PF04827 Plant_tran 189-255 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057770844.1`	Pfam	`PF04827`	Plant_tran	Family	189	255	3.8e-27	96.0	Plant transposon protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914861.1
ATGCCTGTCAATGATAACTCTTCACTTGATTCAAACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCAAATGAATTCGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAATATCATCGAGAATATGATCCTAACCAATACTAATTTGTTTGTAGGACATCAAATTCCAATAGCTAGGAGGAGATATTGTGATAGGGAATGTGAGCTTGGTGCAGAGCGTTTAATCAACGACTATTTTGGTACCAGCCCGACGTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990637
ATGCCTGTCAATGATAACTCTTCACTTGATTCAAACTCAAGTTCTGATGTTTCCCATTCAAATGAATTCGATGAATGGGAAGAACGAGTTTATCAACAAAATCGTCAATTTGATAATATCATCGAGAATATGATCCTAACCAATACTAATTTGTTTGTAGGACATCAAATTCCAATAGCTAGGAGGAGATATTGTGATAGGGAATGTGAGCTTGGTGCAGAGCGTTTAATCAACGACTATTTTGGTACCAGCCCGACGTA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770844.1
MPVNDNSSLDSNSSSDVSHSNEFDEWEERVYQQNRQFDNIIENMILTNTNLFVGHQIPIARRRYCDRECELGAERLINDYFGTSPTYPPERRDATGRLGLSALQKCTAAMRVLAYGTSSDVVNEYLRMSSSATREALVHFVEDVISYFSDTYLRRPNEQDLGKVENQRSFWKMLHHTTCGYDMRSLEYQIRKHKLFAQHQESMRKDVERAFGVLQARLAFLRRPCLIWDKILMGKVMMACIIMHNMILEDERDTYQNYYD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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