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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001839`

染色体: Chr06 坐标: 21592304-21595721 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001839`
名称	SmilChr06G001839
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21592304 - 21595721 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130987483`
GeneID	`130987483`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130987483`
原始查询	`SmilChr06G001839`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
产物	very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase 1-like
Arabidopsis	`AT1G67730` (KCR1) beta-ketoacyl reductase 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:843098] identity=67.2; qcov=1; evalue=1.26e-167; confidence=high
Rice	`Os04g0483500` (KCR1) - identity=59.5; qcov=0.988; evalue=1.62e-141; confidence=high
GO	GO:0005783 (endoplasmic reticulum); GO:0045703 (ketoreductase activity)
KEGG	smil00062 (Fatty acid elongation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01040 (Biosynthesis of unsaturated fatty acids - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01110 (Biosynthesis of secondary metabolites - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01212 (Fatty acid metabolism - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00106 (adh_short); PF08659 (KR); PF13561 (adh_short_C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130987483

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057766999.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057766999.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057766999.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057766999.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057766999.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21592461`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C54
`Chr6:21592461`	`ATC`	`A`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C54
`Chr6:21592519`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr6:21592756`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B138
`Chr6:21593050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr6:21594734`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr6:21595308`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A24,B104,B108
`Chr6:21595386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A23

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057766999.1

320 aa

160

320

adh_short

adh_short_C2

PF00106 adh_short 55-247 aa PF08659 KR 56-220 aa PF13561 adh_short_C2 63-248 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057766999.1`	Pfam	`PF00106`	adh_short	Domain	55	247	2.2e-39	135.7	short chain dehydrogenase
`XP_057766999.1`	Pfam	`PF08659`	KR	Family	56	220	4.1e-05	24.3	KR domain
`XP_057766999.1`	Pfam	`PF13561`	adh_short_C2	Domain	63	248	3e-22	80.1	Enoyl-(Acyl carrier protein) reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057911016.1
TTCAACAAAAAGTGCAATTTAATTTTTTTTCACACTACCATATCAGGTCTAGTAGTAGTACCAATATATATATATATATATATATACAAATTTATTTCAAAGACGCCAAGTCCTCAAAATCATCGCTCATGGCGGACTGCATCTTCGAGCAGCTCAAATCTCAGCCCACATGGCTCCTCCTGCTCTTCTCCCTCGGCTCCTTCTCCCTCCTCAAACTCTCCCTGTCCATCCTCAAATGGGCCTACGTCAATTTCCTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130987483
ATGGCGGACTGCATCTTCGAGCAGCTCAAATCTCAGCCCACATGGCTCCTCCTGCTCTTCTCCCTCGGCTCCTTCTCCCTCCTCAAACTCTCCCTGTCCATCCTCAAATGGGCCTACGTCAATTTCCTCCGCCCCGGCAAGAACCTCAAGAAATACGGGTCGTGGGCCGTAATCACGGGCCCCACCGACGGCATCGGCAAATCCTTCGCATTTCAGCTGTCGCGAAAAGGGCTCAACTTGGTTCTAGTTGGGCGGAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057766999.1
MADCIFEQLKSQPTWLLLLFSLGSFSLLKLSLSILKWAYVNFLRPGKNLKKYGSWAVITGPTDGIGKSFAFQLSRKGLNLVLVGRSPNKLEEVSGAIKSKSGSTQIKTVVVDFSGDLDDGVARIKEAIEGLDVGLLINNVGVSYPYARFFHEVDEKLLNDLIRVNVLGTTKVTQAVLPGMVERKKGAIVNIGSGAAIVIPSDPLYSVYAATKAYIDQFSRCLYVEYKKSGIDVQCQVPLYVATKMASIRRSSFFVPSADG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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