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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr06G001856`

染色体: Chr06 坐标: 21923738-21934985 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr06G001856`
名称	SmilChr06G001856
描述	RNA-binding protein Y14-like
染色体 / SeqID	Chr06 / NC_080392.1
坐标与链方向	21923738 - 21934985 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130990643`
GeneID	`130990643`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130990643`
原始查询	`SmilChr06G001856`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Arabidopsis/Rice homolog
描述	RNA-binding protein Y14-like
产物	RNA-binding protein Y14-like
Arabidopsis	`AT1G51510` (Y14) RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:841576] identity=63.2; qcov=0.633; evalue=1.76e-44; confidence=medium
Rice	`Os05g0140500` (OsY14a) - identity=62.5; qcov=0.372; evalue=1.41e-26; confidence=low
GO	GO:0003729 (mRNA binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008380 (RNA splicing); GO:0035145 (exon-exon junction complex)
KEGG	smil03013 (Nucleocytoplasmic transport - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil03040 (Spliceosome - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130990643

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057770852.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057770852.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057770852.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057770852.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057770852.1`

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EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr6:21923963`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A6,C7
`Chr6:21923965`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A19
`Chr6:21924049`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A22,B121,B86,C81,D6
`Chr6:21924068`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B140,B52
`Chr6:21924143`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B3,B36,B81,B98,D9
`Chr6:21924158`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C24

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预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057914869.1
AGATTACTTATACTTTTAAATAATTTAGTTAAATAACTATTACCGTGCATCGCACGGGAGCAAAACTAGTAAGACTTAAATAGCACAGCCAAAAAGCACATAATAACCCCTCGTTTTTCTACTTATTTGTCTACTCATTAGCACAACCCTCGTTTTTCTTCAAAATCCCTTTAGCCCTTCCCCTCCTATCCCCAAATCTAAACCTAGCTAAATATCTGCTTCAATGGCGAATGCGGAGGCGGAGGCCGTCGATTTCGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130990643
ATGGCGAATGCGGAGGCGGAGGCCGTCGATTTCGAGCCTGAGGAGGACGATCTTATGGACGAGGATGTCGGCGATGGCTCCCCCAACCGAGCCACCGTTCCTCGCCTGAAGTCCGCCATCACTGGCGGCGGCTCCTCCACCGCTCCAAAGAAGACCAAGGGCCGCGGGTTTCGCGACGAGGCCGCTTCTGAAGCGGACCGAAATGCTCGCATGTCCGCCCCCTTCGATTCGCTCGATTCAGAAGGCGGTCCTGGCCCCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057770852.1
MANAEAEAVDFEPEEDDLMDEDVGDGSPNRATVPRLKSAITGGGSSTAPKKTKGRGFRDEAASEADRNARMSAPFDSLDSEGGPGPERSIEGWIILVTGVHEEAQEDDLRNAFGDFGEIMSQPATLNDNLAGVMTWEKRIPPPLQLEGRLRRAAALAAAAAGRQAASCFPPHLISFLSRSREKKSEETQVPQSEIVSAAPEISGDIVTSSRRRSA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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